RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	RPC53	P25441	422 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YEL043W	P32618	956 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	PCH2	P38126	564 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	SLM1	P40485	686 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	RMT2	Q03305	412 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	INH1	P01097	85 aa		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SMF2	P38778	549 aa		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	LCB2	P40970	561 aa		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	LST7	P53237	242 aa		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RET3	P53600	189 aa		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	CLB6	P32943	380 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	YNL320W	P42840	284 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SRB7	P47822	140 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	YPR078C	Q06813	372 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	TFC7	Q12415	435 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	DAP2	P18962	818 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	DSE1	P40077	573 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	EPL1	P43572	832 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	TPC1	P53257	314 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	GPM3	Q12326	303 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPN6	Q12377	434 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	TRM10	Q12400	293 aa		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	YKL187C	P34231	750 aa		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	ATG7	P38862	630 aa		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SDS23	P53172	527 aa		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SRN2	Q99176	213 aa		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	PHO80	P20052	293 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	MSK1	P32048	576 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPN12	P32496	274 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	CSE1	P33307	960 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	NRG2	P38082	220 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	MLH1	P38920	769 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.62	□□□□□ -2.31	not detected
VIK1	YPL253C	POP2	P39008	433 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SPH1	Q06160	661 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	ERP3	Q12403	225 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	CDC42	P19073	191 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	CAB3	P36076	571 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	PMT4	P46971	762 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	VPS68	Q12016	184 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	ISA2	Q12425	185 aa		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	MHP1	P43638	1398 aa		0.61	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	DAN1	P47178	298 aa		0.61	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	UFD1	P53044	361 aa		0.61	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	CSM3	Q04659	317 aa		0.61	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	TIM22	Q12328	207 aa		0.61	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	YAK1	P14680	807 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.6	□□□□□ -2.31	not detected
VIK1	YPL253C	DSK2	P48510	373 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	AIM33	Q04516	312 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	MIM1	Q08176	113 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	FSH3	Q99369	266 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SWE1	P32944	819 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	UBX2	Q04228	584 aa		0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
VIK1	YPL253C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	PSO2	P30620	661 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	MRPS5	P33759	307 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	YFR054C	P43622	192 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	AQR1	P53943	586 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	YOR012W	Q12351	137 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.59	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	GRR1	P24814	1151 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	SNL1	P40548	159 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	PIR5	P46999	287 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	PEX27	Q08580	376 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	TFS1	P14306	219 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	CKI1	P20485	582 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	JNM1	P36224	373 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	YBL028C	P38202	106 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	YMR166C	Q03829	368 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	SMP3	Q04174	516 aa		0.58	□□□□□ -2.32
VIK1	YPL253C	DCR2	Q05924	578 aa		0.58	□□□□□ -2.32

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