RNA–Protein interactions for RNA: YOR174W

MED4, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene MED4, Length 855 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MED4	YOR174W	UBA3	Q99344	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	CDC42	P19073	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	YSR3	P23501	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	DAL2	P25335	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	SBE22	P38814	852 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	FMP33	P46998	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	DAP1	Q12091	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	ZRT1	P32804	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	TCD1	P38756	429 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	YHR045W	P38775	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	TDA11	P38854	504 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	MAM33	P40513	266 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	OKP1	P53298	406 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	MKC7	P53379	596 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	WSC2	P53832	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	BOP2	Q06150	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	PCL9	Q12477	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	CDC23	P16522	626 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	HEM15	P16622	393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	AGA1	P32323	725 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	DFG10	P40526	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	YCH1	P42937	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	BNA6	P43619	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	LCB3	P47013	409 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	YJL118W	P47022	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	BIO4	P53630	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	HCH1	P53834	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	PET117	Q02771	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	IRC4	Q03036	179 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	ALE1	Q08548	619 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED4	YOR174W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	MEI5	P32489	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	KAR9	P32526	644 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	TAE1	P38340	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	YNL320W	P42840	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	AGP3	P43548	558 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	COX20	Q04935	205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	GMC2	Q06201	188 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SRL1	Q08673	210 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	RGT2	Q12300	763 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	DTR1	P38125	572 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SMF2	P38778	549 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	MDM31	P38880	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	HAC1	P41546	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	KAP114	P53067	1004 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SED5	Q01590	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	CTS2	Q06350	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	YBT1	P32386	1661 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
MED4	YOR174W	TRP1	P00912	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	COS9	P36034	407 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	AVT5	P38176	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	FMC1	P40491	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	YJL213W	P40896	331 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	COS10	P52924	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	MTQ1	P53944	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	TDA1	Q03533	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	BSC6	Q08280	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	FCY22	Q12119	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	MSF1	P08425	469 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	MSN4	P33749	630 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SPO23	P33757	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	YHR035W	P38769	630 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	PRM5	P40476	318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	BIO3	P50277	480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SCS3	P53012	380 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	DDC1	Q08949	612 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	APC9	Q12107	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	RAD3	P06839	778 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	NAM2	P11325	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	PRR1	P28708	518 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SUA5	P32579	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED4	YOR174W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected

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