RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	YGR066C	P53242	292 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GRX5	Q02784	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YML108W	Q03759	105 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	COS7	Q07788	383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	BSC1	Q12140	328 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RIB3	Q99258	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	BPH1	P25356	2167 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RHB1	P25378	209 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YIM1	P28625	365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RIB1	P38066	345 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GPX2	P38143	162 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ARN2	P38724	620 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ANS1	P38832	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	PET100	P38958	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YAR028W	P39548	234 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	FAR7	P43592	221 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	PRY1	P47032	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	BUR2	Q05949	395 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MET2	P08465	486 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GIT1	P25346	518 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YCL049C	P25577	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	HCS1	P34243	683 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MGE1	P38523	228 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YLF2	P38746	405 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	NSG1	P38837	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YJL193W	P39542	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YER010C	P40011	234 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
NDC1	YML031W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	DAM1	P53267	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SNF12	P53628	566 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SWA2	Q06677	668 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GSH2	Q08220	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
NDC1	YML031W	RPN6	Q12377	434 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SNF8	Q12483	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	NFS1	P25374	497 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YHR177W	P38867	453 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GAB1	P41733	394 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	INP1	Q03694	420 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	DBF2	P22204	572 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YPT7	P32939	208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	TOD6	P34219	525 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YHK8	P38776	514 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SEN34	P39707	275 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	COG3	P40094	801 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	CPR8	P53728	308 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YNR040W	P53736	256 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	THP1	Q08231	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ACF2	Q12168	779 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RBD2	Q12270	262 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GAL3	P13045	520 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	CBS1	P14066	229 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	CTA1	P15202	515 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	PDX1	P16451	410 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ARO7	P32178	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RTG1	P32607	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	FMP23	P38231	175 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	ATG14	P38270	344 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SMK1	P41808	388 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	NUP49	Q02199	472 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MAK3	Q03503	176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	NAT4	Q04751	285 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SYO1	Q07395	620 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MFG1	Q07684	458 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	HNT3	Q08702	217 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	SWM1	Q12379	170 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	HSP30	P25619	332 aa		4.65	□□□□□ -1.66

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