RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C SAP155P43612 1002 aa9.4□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C INP54Q08227 384 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C OSM1P21375 501 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C YCK3P39962 524 aa9.39□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C RTG3P38165 486 aa9.38□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C MHP1P43638 1398 aa9.37□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C CTT1P06115 562 aa9.36□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C MSN5P52918 1224 aa9.35□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C HIM1Q06674 414 aa9.35□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C HPC2Q01448 625 aa9.34□□□□□ -0.91
SPE3YPR069C ERT1P38140 529 aa9.33□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C RRD1P40454 393 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C YKL222CP35995 705 aa9.32□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C YBP2P53169 641 aa9.32□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C NUP145P49687 1317 aa9.31□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C YER156CP40093 338 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C CTF4Q01454 927 aa9.31□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C KIN4Q01919 800 aa9.3□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C RRT14P40470 206 aa9.29□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C DSD1P53095 428 aa9.29□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SPE3YPR069C NYV1Q12255 253 aa9.27□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C KAR2P16474 682 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C HSP104P31539 908 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C NST1P53935 1240 aa9.26□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C TOM1Q03280 3268 aa9.25□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data9.25□□□□□ -0.93not detected
SPE3YPR069C CWH41P53008 833 aa9.25□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C PMD1P32634 1753 aa9.24□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C SSA4P22202 642 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C SQS1P53866 767 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C PDS5Q04264 1277 aa9.24□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C PFF1P38244 976 aa9.23□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C PEX21P50091 288 aa9.23□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C FPK1P53739 893 aa9.22□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C MDG1P53885 366 aa9.22□□□□□ -0.93
SPE3YPR069C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C RMT2Q03305 412 aa9.21□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C PUS5Q06244 254 aa9.21□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C TEA1P47988 759 aa9.19□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C AOS1Q06624 347 aa9.19□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C CTI6Q08923 506 aa9.19□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C PHM7Q12252 991 aa9.19□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C LPD1P09624 499 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C HKR1P41809 1802 aa9.17□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C KCC4P25389 1037 aa9.17□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C SMY1P32364 656 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data9.17□□□□□ -0.94not detected
SPE3YPR069C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C NTH2P35172 780 aa9.15□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C PAP2P53632 584 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C ERO1Q03103 563 aa9.15□□□□□ -0.94
SPE3YPR069C SER1P33330 395 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C ALE1Q08548 619 aa9.13□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C TRK1P12685 1235 aa9.12□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C SSP2Q08646 371 aa9.12□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C FIG2P25653 1609 aa9.12□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C SLI15P38283 698 aa9.11□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C SHC1P39000 512 aa9.11□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C BDF2Q07442 638 aa9.11□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C ATG20Q07528 640 aa9.11□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C SIT4P20604 311 aa9.1□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C UGA3P26370 528 aa9.1□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C POL5P39985 1022 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C IRC3Q06683 689 aa9.1□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C RET1P22276 1149 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C YGL082WP53155 381 aa9.09□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C ISW2Q08773 1120 aa9.09□□□□□ -0.95
SPE3YPR069C YLR278CQ05854 1341 aa9.08□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C TOP1P04786 769 aa9.08□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C ARG8P18544 423 aa9.08□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C YKU70P32807 602 aa9.08□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C RTG2P32608 588 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C LYS2P07702 1392 aa9.07□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C THS1P04801 734 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C GRX6Q12438 231 aa9.06□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C YNL050CP53952 270 aa9.05□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C NSE3Q05541 303 aa9.05□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C DCD1P06773 312 aa9.04□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C UBP16Q02863 499 aa9.04□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C YPR204WQ08995 1032 aa9.03□□□□□ -0.96
SPE3YPR069C CAF20P12962 161 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C ETP1P38748 585 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C HAT1Q12341 374 aa9.02□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C POM152P39685 1337 aa9.02□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C DUS1P53759 423 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms