RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	YBL036C	P38197	257 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	YJR115W	P47152	169 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	YPR084W	Q06821	456 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	UGA3	P26370	528 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	CSE4	P36012	229 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	MET22	P32179	357 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	GUT2	P32191	649 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	BIO2	P32451	375 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	YBL086C	P38177	466 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	ISF1	P32488	338 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PEX18	YHR160C	YJL007C	P47080	104 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	YNL108C	P53929	270 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	FRA1	Q07825	749 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	SRF1	Q12516	437 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	EMP47	P43555	445 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	YDR444W	Q04093	687 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	ENV9	Q08651	330 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	MCM16	Q12262	181 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	MKS1	P34072	584 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	DFG5	Q05031	458 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	RTT106	P40161	455 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	AAD14	P42884	376 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	ATG20	Q07528	640 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PEX18	YHR160C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	FBP26	P32604	452 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	BIM1	P40013	344 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	OPT2	Q06593	877 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	ARG82	P07250	355 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.01	□□□□□ -1.29	not detected
PEX18	YHR160C	ATG32	P40458	529 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	NUP85	P46673	744 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	DMA2	P53924	522 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	DLD1	P32891	587 aa		7	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	APL6	P46682	809 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	BDS1	Q08347	646 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	STE6	P12866	1290 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	MRX12	P47084	519 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	ISU1	Q03020	165 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PEX18	YHR160C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	RIM21	P48565	533 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	YLR346C	Q06139	101 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	YPP1	P46951	817 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	YJR098C	P47139	656 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	LSC2	P53312	427 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	YPL062W	Q02781	134 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	YDL176W	Q12027	708 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	SOH1	P38633	127 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	RGA1	P39083	1007 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	MIP1	P15801	1254 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	TCB1	Q12466	1186 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	SCW11	P53189	542 aa		6.91	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	CAF120	P53836	1060 aa		6.91	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	MRX10	Q05648	414 aa		6.91	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		6.91	□□□□□ -1.3
PEX18	YHR160C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	UTR2	P32623	467 aa		6.89	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	ACO2	P39533	789 aa		6.89	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	UBP2	Q01476	1272 aa		6.89	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	WTM2	Q12206	467 aa		6.89	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	ATG3	P40344	310 aa		6.88	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	HDA3	Q06623	655 aa		6.88	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	YPR204W	Q08995	1032 aa		6.88	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	YIR007W	P40566	764 aa		6.86	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	RGA2	Q06407	1009 aa		6.86	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.86	□□□□□ -1.31	not detected
PEX18	YHR160C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	OSH7	P38755	437 aa		6.85	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
PEX18	YHR160C	PEP12	P32854	288 aa		6.82	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	TBS1	P38114	1094 aa		6.82	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	SLX8	P40072	274 aa		6.82	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	SSN3	P39073	555 aa		6.8	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	KTR7	P40504	517 aa		6.8	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	ROG3	P43602	733 aa		6.8	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	DAL1	P32375	460 aa		6.79	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	VTC4	P47075	721 aa		6.79	□□□□□ -1.32
PEX18	YHR160C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32

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