RNA–Protein interactions for RNA: YHL008C

YHL008C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHL008C, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CYHL008C RTG3P38165 486 aa10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C BDH2P39713 417 aa10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C RVS167P39743 482 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C SAP155P43612 1002 aa10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C PBY1P38254 753 aa10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C YMR102CQ03177 834 aa10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C RIM101P33400 625 aa10.09□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C YGL081WP53156 320 aa10.09□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C PAP2P53632 584 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C RSM25P40496 264 aa10.08□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C VPS72Q03388 795 aa10.08□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C SML1Q04964 104 aa10.08□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C MFT1P33441 392 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C SWH1P35845 1188 aa10.08□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C RTT107P38850 1070 aa10.08□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C NUP145P49687 1317 aa10.07□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C GRX3Q03835 250 aa10.06□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C ESL2P36168 1195 aa10.06□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C HST1P53685 503 aa10.06□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C LTE1P07866 1435 aa10.05□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C VPS41P38959 992 aa10.05□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C TIM50Q02776 476 aa10.05□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C NPA3P47122 385 aa10.04□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C TPD3P31383 635 aa10.03□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
YHL008CYHL008C YOR093CQ12275 1648 aa10.02□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C RTC1Q08281 1341 aa10.02□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C RAD51P25454 400 aa10.02□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MPE1P35728 441 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C HAP1P0CE41 1502 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C KEX1P09620 729 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MRC1P25588 1096 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C DLD1P32891 587 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MNR2P35724 969 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MRPL10P36520 322 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C TLG2Q08144 397 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C APC11Q12157 165 aa10.01□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MSH1P25846 959 aa10□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C ARP5P53946 755 aa10□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C VPS20Q04272 221 aa10□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C SNF2P22082 1703 aa10□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C SEC39Q12745 709 aa10□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C VPS30Q02948 557 aa9.99□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C HRQ1Q05549 1077 aa9.99□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C DRS2P39524 1355 aa9.99□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C BIK1P11709 440 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C DID4P36108 232 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C YKL068W-AQ3E826 78 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C RAD3P06839 778 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C SPE2P21182 396 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C CWH41P53008 833 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C YNL050CP53952 270 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MDM38Q08179 573 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C RAV1P47104 1357 aa9.98□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C TAF13P11747 167 aa9.96□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C HYR1P40581 163 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C GIN4Q12263 1142 aa9.96□□□□□ -0.81
YHL008CYHL008C KRE5P22023 1365 aa9.96□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C CSE4P36012 229 aa9.96□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.96□□□□□ -0.82not detected
YHL008CYHL008C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C MSB4Q12317 492 aa9.96□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C RAD50P12753 1312 aa9.95□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C PSK1P31374 1356 aa9.95□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C FKH1P40466 484 aa9.95□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C GCR2Q01722 534 aa9.95□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C RIO2P40160 425 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C PDR11P40550 1411 aa9.94□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C THI22Q06490 572 aa9.94□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C DOP1Q03921 1698 aa9.94□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C SES1P07284 462 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C SLD2P34252 453 aa9.93□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C BDP1P46678 594 aa9.93□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C NKP2Q06162 153 aa9.93□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C HSP104P31539 908 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C YGL082WP53155 381 aa9.92□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C SSL2Q00578 843 aa9.92□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C BRN1P38170 754 aa9.91□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
YHL008CYHL008C ERV41Q04651 352 aa9.91□□□□□ -0.82
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