RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W RAD26P40352 1085 aa15.1■□□□□ 0.01
SSA4YER103W YGL081WP53156 320 aa15.1■□□□□ 0.01
SSA4YER103W USO1P25386 1790 aa15.1■□□□□ 0.01
SSA4YER103W AUS1Q08409 1394 aa15.1■□□□□ 0.01
SSA4YER103W MIC60P36112 540 aa15.09■□□□□ 0.01
SSA4YER103W PDI1P17967 522 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SSA4YER103W BRN1P38170 754 aa15.09■□□□□ 0.01
SSA4YER103W HST1P53685 503 aa15.09■□□□□ 0.01
SSA4YER103W SPT21P35209 758 aa15.07■□□□□ 0
SSA4YER103W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SSA4YER103W VPS20Q04272 221 aa15.07■□□□□ 0
SSA4YER103W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SSA4YER103W RFC1P38630 861 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
SSA4YER103W SMC3P47037 1230 aa15.05■□□□□ -0
SSA4YER103W URN1Q06525 465 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
SSA4YER103W TCD1P38756 429 aa15.04■□□□□ -0
SSA4YER103W RSM25P40496 264 aa15.04■□□□□ -0
SSA4YER103W HRQ1Q05549 1077 aa15.04■□□□□ -0
SSA4YER103W HXT13P39924 564 aa15.03■□□□□ -0
SSA4YER103W KEX1P09620 729 aa15.02■□□□□ -0
SSA4YER103W GRX4P32642 244 aa15.02□□□□□ -0.01
SSA4YER103W YNG2P38806 282 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SSA4YER103W RNR2P09938 399 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SSA4YER103W BIK1P11709 440 aa15□□□□□ -0.01
SSA4YER103W STU2P46675 888 aa15□□□□□ -0.01
SSA4YER103W SPO1P53541 631 aa15□□□□□ -0.01
SSA4YER103W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SSA4YER103W RCM1P53972 490 aa15□□□□□ -0.01
SSA4YER103W LTV1P34078 463 aa14.98□□□□□ -0.01
SSA4YER103W HYR1P40581 163 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SSA4YER103W RTF1P53064 558 aa14.98□□□□□ -0.01
SSA4YER103W HXT17P53631 564 aa14.98□□□□□ -0.01
SSA4YER103W PPH3P32345 308 aa14.98□□□□□ -0.01
SSA4YER103W GYP7P48365 746 aa14.98□□□□□ -0.01
SSA4YER103W CYC8P14922 966 aa14.97□□□□□ -0.01
SSA4YER103W KRI1P42846 591 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SSA4YER103W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SSA4YER103W APC11Q12157 165 aa14.97□□□□□ -0.01
SSA4YER103W CSI1Q04368 295 aa14.96□□□□□ -0.01
SSA4YER103W LYS2P07702 1392 aa14.96□□□□□ -0.01
SSA4YER103W CIN4P39110 191 aa14.96□□□□□ -0.02
SSA4YER103W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SSA4YER103W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SSA4YER103W CWH41P53008 833 aa14.94□□□□□ -0.02
SSA4YER103W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SSA4YER103W DID4P36108 232 aa14.94□□□□□ -0.02
SSA4YER103W DSD1P53095 428 aa14.94□□□□□ -0.02
SSA4YER103W SFI1Q12369 946 aa14.94□□□□□ -0.02
SSA4YER103W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SSA4YER103W SRT1Q03175 343 aa14.93□□□□□ -0.02
SSA4YER103W PBY1P38254 753 aa14.92□□□□□ -0.02
SSA4YER103W TRL1P09880 827 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SSA4YER103W MPE1P35728 441 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SSA4YER103W MRPL10P36520 322 aa14.92□□□□□ -0.02
SSA4YER103W APC1P53886 1748 aa14.91□□□□□ -0.02
SSA4YER103W VPS60Q03390 229 aa14.9□□□□□ -0.02
SSA4YER103W TIM50Q02776 476 aa14.9□□□□□ -0.02
SSA4YER103W CEP3P40969 608 aa14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W CDC16P09798 840 aa14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W CLB5P30283 435 aa14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W YNL050CP53952 270 aa14.88□□□□□ -0.03
SSA4YER103W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SSA4YER103W RNA1P11745 407 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SSA4YER103W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SSA4YER103W MFT1P33441 392 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SSA4YER103W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data14.86□□□□□ -0.03not detected
SSA4YER103W PEX19Q07418 342 aa14.86□□□□□ -0.03
SSA4YER103W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SSA4YER103W MRX12P47084 519 aa14.86□□□□□ -0.03
SSA4YER103W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SSA4YER103W TAF13P11747 167 aa14.85□□□□□ -0.03
SSA4YER103W SSL2Q00578 843 aa14.85□□□□□ -0.03
SSA4YER103W YBR287WP38355 427 aa14.84□□□□□ -0.03
SSA4YER103W MAM1P40065 302 aa14.84□□□□□ -0.03
SSA4YER103W MNR2P35724 969 aa14.83□□□□□ -0.04
SSA4YER103W GAS4Q08271 471 aa14.83□□□□□ -0.04
SSA4YER103W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SSA4YER103W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SSA4YER103W SES1P07284 462 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSA4YER103W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SSA4YER103W DEP1P31385 405 aa14.8□□□□□ -0.04
SSA4YER103W CLB1P24868 471 aa14.8□□□□□ -0.04
SSA4YER103W CCT5P40413 562 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSA4YER103W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SSA4YER103W ELM1P32801 640 aa14.78□□□□□ -0.04
SSA4YER103W NPR3P38742 1146 aa14.78□□□□□ -0.04
SSA4YER103W CWC22P53333 577 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SSA4YER103W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SSA4YER103W BDP1P46678 594 aa14.76□□□□□ -0.05
SSA4YER103W NTH2P35172 780 aa14.75□□□□□ -0.05
SSA4YER103W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SSA4YER103W DPS1P04802 557 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W ATE1P16639 503 aa14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W CPS1P27614 576 aa14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RAD24P32641 659 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.8 ms