RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rsph4aQ8BYM7 716 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Efcab5A0JP43 1406 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 GorabQ8BRM2 368 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dapk1Q80YE7 1442 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cabp4Q8VHC5 271 aa16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Esx1O88933 382 aa16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kif7B7ZNG0 1348 aa16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ap3b2Q9JME5 1082 aa16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Shroom4Q1W617 1475 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 HdgfP51859 237 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ipo8Q7TMY7 1010 aa16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zscan10Q3URR7 782 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Stk31Q99MW1 1018 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rock1P70335 1354 aa16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc60Q8C4J0 545 aa16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 GsdmaQ9EST1 446 aa16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 MecomP14404 1042 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pde4cQ3UEI1 686 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ncoa2Q61026 1462 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Brpf1B2RRD7 1212 aa16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pak3Q61036 559 aa16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc146E9Q9F7 977 aa16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ChgaP26339 463 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pcmtd1P59913 357 aa16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chmp3Q9CQ10 224 aa16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ErbinQ80TH2 1402 aa16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Naip1Q9QWK5 1403 aa16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ipo9Q91YE6 1041 aa16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Iffo2Q8R2V2 512 aa16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Duox2A2AQ99 1517 aa16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anapc15P60007 132 aa16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Map3k5O35099 1380 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pde3bQ61409 1100 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CgnP59242 1191 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Erich6bQ9D4S6 220 aa16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nsd2Q8BVE8 1365 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q9D9H8 365 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ralbp1Q62172 648 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cux1P53564 1515 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arap1Q4LDD4 1452 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Vps8Q0P5W1 1427 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ift140E9PY46 1464 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prdm16A2A935 1275 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Irx3P81067 507 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NrkQ9R0G8 1455 aa16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PtprkP35822 1457 aa16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gsto1O09131 240 aa16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q7TT23 1179 aa16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc30Q8BVF4 654 aa16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ttll5Q8CHB8 1328 aa16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Grin2bQ01097 1482 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cd109Q8R422 1442 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ubap1lG3UW59 384 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Triml2E9PW10 424 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fyb1O35601 819 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nectin2P32507 530 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trim58Q5NCC9 485 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Usp16Q99LG0 825 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arhgap5P97393 1501 aa16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cgnl1Q6AW69 1298 aa16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AU015836B2RUM3 263 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AppP12023 770 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pank1Q8K4K6 548 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Frmpd1A2AKB4 1549 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fgd6Q69ZL1 1399 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nutm1Q8BHP2 1126 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chmp7Q8R1T1 451 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf710Q3U288 666 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm973E9Q295 1059 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ric3Q8BPM6 367 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Bcl11aQ9QYE3 773 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 SlkO54988 1233 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.9 ms