RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NischQ80TM9 1593 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gab3Q8BSM5 595 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trim41Q5NCC3 630 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zeb1Q64318 1117 aa20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Npm2Q80W85 207 aa20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Wdr66E9Q743 1299 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ube2uB1AUC4 352 aa20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Myt1lP97500 1187 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Il27Q8K3I6 234 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Abcc9P70170 1546 aa19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 HrcG5E8J6 738 aa19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NefmP08553 848 aa19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc180J3QNE4 1664 aa19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc24a1Q91WD8 1130 aa19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Abcc8B2RUS7 1588 aa18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Neurod1Q60867 357 aa18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rtl1Q7M732 1744 aa18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Stra8P70278 393 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pcgf6Q99NA9 353 aa18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CenpbP27790 599 aa18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NclP09405 707 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lmod2Q3UHZ5 550 aa18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mier1Q5UAK0 511 aa18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NrdcQ8BHG1 1161 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 TonslQ6NZL6 1363 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Os9Q8K2C7 672 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chic1Q8CBW7 227 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Amer1Q7TS75 1132 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tnnt3Q9QZ47 272 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eid3Q3V124 375 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NeflP08551 543 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zbtb4Q5F293 982 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Clip1Q922J3 1391 aa18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dcaf1Q80TR8 1506 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ubl4bQ9CQ84 188 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cep164Q5DU05 1446 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ClspnQ80YR7 1315 aa18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Erich6D3Z6S9 713 aa18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm13697A2AK42 830 aa18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sall2Q9QX96 1004 aa18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4933416C03RikQ3V063 378 aa18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp1b4Q99ME6 356 aa18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chic2Q9D9G3 165 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NacadQ5SWP3 1504 aa17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plppr3Q7TPB0 716 aa17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BlmO88700 1416 aa17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nlrp6Q91WS2 869 aa17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccer2J3QPU5 274 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm13695A2AK44 830 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm38655A0A286YDK6 273 aa17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Setd5Q5XJV7 1441 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Polr3glQ8R0C0 218 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Baz1aO88379 1555 aa17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kif15Q6P9L6 1387 aa17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Golga3P55937 1487 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Csrnp3P59055 597 aa17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Myt1Q8CFC2 1127 aa17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anp32aO35381 247 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrs2Q5NCE8 434 aa17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anks4bQ8K3X6 423 aa17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rgl3Q3UYI5 709 aa17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kdm5dQ62240 1548 aa17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ArxO35085 564 aa17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rtl5Q5DTT4 599 aa17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Clstn2Q9ER65 966 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 157.6 ms