Protein–RNA interactions for Protein: P97393

Arhgap5, Rho GTPase-activating protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap5P97393 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60,18■■■■■ 7,22
Arhgap5P97393 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55,95■■■■■ 6,55
Arhgap5P97393 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,88■■■■■ 6,38
Arhgap5P97393 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52,47■■■■■ 5,99
Arhgap5P97393 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52,19■■■■■ 5,94
Arhgap5P97393 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51,06■■■■■ 5,76
Arhgap5P97393 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,84■■■■■ 5,73
Arhgap5P97393 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,69■■■■■ 5,7
Arhgap5P97393 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50,53■■■■■ 5,68
Arhgap5P97393 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,17■■■■■ 5,62
Arhgap5P97393 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50,15■■■■■ 5,62
Arhgap5P97393 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49,01■■■■■ 5,44
Arhgap5P97393 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,97■■■■■ 5,43
Arhgap5P97393 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48,61■■■■■ 5,37
Arhgap5P97393 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
Arhgap5P97393 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,5■■■■■ 5,35
Arhgap5P97393 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,43■■■■■ 5,34
Arhgap5P97393 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,36■■■■■ 5,33
Arhgap5P97393 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48,06■■■■■ 5,28
Arhgap5P97393 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,01■■■■■ 5,28
Arhgap5P97393 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,84■■■■■ 5,25
Arhgap5P97393 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,71■■■■■ 5,23
Arhgap5P97393 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47,62■■■■■ 5,21
Arhgap5P97393 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47,62■■■■■ 5,21
Arhgap5P97393 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,45■■■■■ 5,19
Arhgap5P97393 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,35■■■■■ 5,17
Arhgap5P97393 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,09■■■■■ 5,13
Arhgap5P97393 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47,06■■■■■ 5,12
Arhgap5P97393 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,89■■■■■ 5,1
Arhgap5P97393 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,81■■■■■ 5,08
Arhgap5P97393 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46,74■■■■■ 5,07
Arhgap5P97393 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46,68■■■■■ 5,06
Arhgap5P97393 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,6■■■■■ 5,05
Arhgap5P97393 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46,52■■■■■ 5,04
Arhgap5P97393 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46,32■■■■■ 5,01
Arhgap5P97393 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,2■■■■■ 4,99
Arhgap5P97393 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46,16■■■■■ 4,98
Arhgap5P97393 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46,03■■■■■ 4,96
Arhgap5P97393 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
Arhgap5P97393 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,8■■■■■ 4,92
Arhgap5P97393 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45,76■■■■■ 4,92
Arhgap5P97393 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45,59■■■■■ 4,89
Arhgap5P97393 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45,56■■■■■ 4,88
Arhgap5P97393 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
Arhgap5P97393 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
Arhgap5P97393 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,3■■■■■ 4,84
Arhgap5P97393 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,22■■■■■ 4,83
Arhgap5P97393 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45,18■■■■■ 4,82
Arhgap5P97393 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45,17■■■■■ 4,82
Arhgap5P97393 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45,09■■■■■ 4,81
Arhgap5P97393 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45,08■■■■■ 4,81
Arhgap5P97393 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,01■■■■■ 4,8
Arhgap5P97393 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44,96■■■■■ 4,79
Arhgap5P97393 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44,81■■■■■ 4,76
Arhgap5P97393 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Arhgap5P97393 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44,73■■■■■ 4,75
Arhgap5P97393 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,69■■■■■ 4,75
Arhgap5P97393 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44,66■■■■■ 4,74
Arhgap5P97393 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44,64■■■■■ 4,74
Arhgap5P97393 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44,6■■■■■ 4,73
Arhgap5P97393 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44,59■■■■■ 4,73
Arhgap5P97393 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44,57■■■■■ 4,73
Arhgap5P97393 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,53■■■■■ 4,72
Arhgap5P97393 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
Arhgap5P97393 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44,5■■■■■ 4,71
Arhgap5P97393 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44,34■■■■■ 4,69
Arhgap5P97393 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44,34■■■■■ 4,69
Arhgap5P97393 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Arhgap5P97393 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44,11■■■■■ 4,65
Arhgap5P97393 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Arhgap5P97393 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44,1■■■■■ 4,65
Arhgap5P97393 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44,07■■■■■ 4,65
Arhgap5P97393 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,03■■■■■ 4,64
Arhgap5P97393 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,62
Arhgap5P97393 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,87■■■■■ 4,61
Arhgap5P97393 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Arhgap5P97393 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,81■■■■■ 4,6
Arhgap5P97393 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,8■■■■■ 4,6
Arhgap5P97393 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Arhgap5P97393 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
Arhgap5P97393 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43,67■■■■■ 4,58
Arhgap5P97393 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
Arhgap5P97393 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Arhgap5P97393 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43,53■■■■■ 4,56
Arhgap5P97393 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43,48■■■■■ 4,55
Arhgap5P97393 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Arhgap5P97393 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43,38■■■■■ 4,53
Arhgap5P97393 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Arhgap5P97393 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43,35■■■■■ 4,53
Arhgap5P97393 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,52
Arhgap5P97393 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43,28■■■■■ 4,52
Arhgap5P97393 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Arhgap5P97393 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,23■■■■■ 4,51
Arhgap5P97393 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
Arhgap5P97393 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43,13■■■■■ 4,5
Arhgap5P97393 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43,12■■■■■ 4,49
Arhgap5P97393 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,1■■■■■ 4,49
Arhgap5P97393 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,09■■■■■ 4,49
Arhgap5P97393 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Arhgap5P97393 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms