RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	LDB18	Q07887	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	NSL1	Q12143	216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	DRS2	P39524	1355 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	TFC1	P32367	649 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SPT10	P35208	640 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YKL151C	P36059	337 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ARA1	P38115	344 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	FMP23	P38231	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SHG1	P38337	142 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	IKI1	P38874	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	HAT2	P39984	401 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	DSE1	P40077	573 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	LAS21	P40367	830 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	GUF1	P46943	645 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	MTC3	P53077	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	TAM41	P53230	385 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YNR066C	P53752	436 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	IBD2	P53892	351 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	DID2	P69771	204 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	AIM6	Q07716	390 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YNG1	Q08465	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	APC9	Q12107	265 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	FCY22	Q12119	530 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	REV3	P14284	1504 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YOR1	P53049	1477 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PCT1	P13259	424 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	CUP2	P15315	225 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	TUP1	P16649	713 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YIM1	P28625	365 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	MYO3	P36006	1272 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ECM13	P38195	257 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	APN2	P38207	520 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	POP4	P38336	279 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	HIS2	P38635	335 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ATG7	P38862	630 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RRG9	P40156	214 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	CSM2	P40465	213 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PMT6	P42934	759 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YFR057W	P43625	151 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	CIN2	P46670	268 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YJR030C	P47101	745 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	UFD1	P53044	361 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SAE3	P89114	91 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	AIM34	Q03673	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PLM2	Q04383	521 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	COQ11	Q05892	277 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	BUR2	Q05949	395 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PLB3	Q08108	686 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YPL260W	Q08977	551 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ACM1	Q08981	209 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RUP1	Q12242	671 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RKM5	Q12367	367 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PUT2	P07275	575 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	NAM2	P11325	894 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
YPT53	YNL093W	CPT1	P17898	393 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	DCC1	P25559	380 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	FUB1	P25659	250 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	IES6	P32617	166 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	GDA1	P32621	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RRN10	P38204	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	LEU5	P38702	357 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	RBG1	P39729	369 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	PAC2	P39937	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	FMP52	P40008	231 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YPT53	YNL093W	COA1	P40452	197 aa		3.74	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.3 ms