RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TMN2	Q04562	672 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPD1	Q07688	167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ERP3	Q12403	225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RPB8	P20436	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RAD57	P25301	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	FUB1	P25659	250 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MRPS5	P33759	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MRX3	P38172	270 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	DER1	P38307	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	DBP8	P38719	431 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CYC2	P38909	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	LAS21	P40367	830 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	POP1	P41812	875 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SFH5	P47008	294 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	BUL1	P48524	976 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SBH2	P52871	88 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	BUD17	P53727	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IRC13	Q08630	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ARP6	Q12509	438 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	DST1	P07273	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	EHD3	P28817	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SHP1	P34223	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YAP3	P38749	330 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PHM8	P40025	321 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	AZR1	P50080	613 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NBP35	P52920	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	OKP1	P53298	406 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MKC7	P53379	596 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	HSP31	Q04432	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IMA2	Q08295	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MCA1	Q08601	432 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	EMP46	Q12396	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RAD50	P12753	1312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CYC7	P00045	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ATP6	P00854	259 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CLG1	P35190	452 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RIB5	P38145	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	BMT5	P40493	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IDP2	P41939	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TOS2	P50078	622 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CDC14	Q00684	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	LDS2	Q08218	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ACF2	Q12168	779 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SNF3	P10870	884 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	URA6	P15700	204 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ITR2	P30606	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COG2	P53271	262 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	VBA1	Q04301	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RIF2	Q06208	395 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ASA1	Q06822	443 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	THI72	Q08579	599 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	LCB4	Q12246	624 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	STE4	P18851	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COQ2	P32378	372 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	NUP2	P32499	720 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MRPL6	P32904	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YKL097C	P34245	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	FMP52	P40008	231 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COX15	P40086	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MGA1	P53050	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YIP4	P53093	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YNR066C	P53752	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SNO2	P53823	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RFU1	Q08003	200 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	CPT1	P17898	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TCA17	P32613	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MSN2	P33748	704 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	CPR5	P35176	225 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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