RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W MKC7P53379 596 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W REX2P54964 269 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W ATC1Q04005 294 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RIF2Q06208 395 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YDL114WQ07530 308 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W NDD1Q08887 554 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YDL109CQ12103 647 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YDL199CQ12407 687 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W UNG1P12887 359 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W FUN26P31381 517 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W COT1P32798 439 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YPT53P36019 220 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W DTR1P38125 572 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SMF2P38778 549 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SPT8P38915 602 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RCY1P39531 840 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YNL320WP42840 284 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W KEL2P50090 882 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SHE10P53075 577 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W OKP1P53298 406 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W CWC22P53333 577 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W BIO4P53630 237 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YPL080CQ02826 108 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W ERV2Q12284 196 aa4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W DAL2P25335 343 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W ZRT1P32804 376 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YBL059WP34224 193 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W PET100P38958 111 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YAT2P40017 923 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SCC4P40090 624 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W NUP84P52891 726 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YGL260WP53056 76 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W HCH1P53834 153 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W DDC1Q08949 612 aa3.99□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W HEM4P06174 275 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W MEI5P32489 222 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W IME2P32581 645 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPT5P33297 434 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W CSE2P33308 149 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W KRE9P39005 276 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W AGX1P43567 385 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YFR057WP43625 151 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W CLD1P53264 445 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SHY1P53266 389 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W IRC4Q03036 179 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W TRM82Q03774 444 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YOL107WQ12239 342 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W HMS1Q12398 434 aa3.98□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RPB5P20434 215 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W HIS2P38635 335 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W CTM1P38818 585 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W EGT2P42835 1041 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W FMP33P46998 180 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YGL242CP53066 181 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W RNH1Q04740 348 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W ERP3Q12403 225 aa3.97□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RSR1P13856 272 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W FRS2P15625 503 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PAN6P40459 309 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W MRX5P47007 382 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W BIR1P47134 954 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SPP2Q02521 185 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YMR027WQ04371 470 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W BER1Q06688 274 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W MFG1Q07684 458 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SLM3Q12093 417 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W APC9Q12107 265 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W FRE8Q12209 686 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W JID1Q12350 301 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RPN6Q12377 434 aa3.96□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PET123P17558 318 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YSR3P23501 404 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W COY1P34237 679 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W RCK2P38623 610 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W YHR035WP38769 630 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W REE1P40893 198 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W AGP3P43548 558 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W CRH1P53301 507 aa3.95□□□□□ -1.78
YKR047WYKR047W SED5Q01590 340 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.8 ms