RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YMR209C	Q03648	457 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	HSP31	Q04432	237 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RTT103	Q05543	409 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	GGA1	Q06336	557 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	GRE1	Q08969	168 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	VIK1	Q12045	647 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	DAP1	Q12091	152 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	USO1	P25386	1790 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	VMR1	P38735	1592 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	TYR1	P20049	452 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RRT12	P25381	491 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	POP5	P28005	173 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MRPL9	P31334	269 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SKT5	P34226	696 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YKL097C	P34245	136 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RIB1	P38066	345 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	ARP1	P38696	384 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	PCL6	P40038	420 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	TRS85	P46944	698 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MRX5	P47007	382 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	UBP8	P50102	471 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MRPL50	P53724	139 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SAM50	P53969	484 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	FMP30	Q02883	468 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	NUP53	Q03790	475 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	GMC2	Q06201	188 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SNA4	Q07549	140 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	TLG2	Q08144	397 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RRI1	Q12468	440 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	IML1	P47170	1584 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SNF3	P10870	884 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	WHI2	P12611	486 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	CLN3	P13365	580 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	PMA2	P19657	947 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MXR2	P25566	168 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MYO3	P36006	1272 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	DOA1	P36037	715 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	ROT2	P38138	954 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MIC12	P38341	106 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	HIS2	P38635	335 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MTW1	P39731	289 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	COA1	P40452	197 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	DSN1	P40568	576 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YGR210C	P42942	411 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	GLG2	P47011	380 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SSN8	P47821	323 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YPT11	P48559	417 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	ASA1	Q06822	443 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	THI3	Q07471	609 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YPQ1	Q12010	308 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	SRO7	Q12038	1033 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	MSH5	Q12175	901 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDP1	YOR163W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	YAK1	P14680	807 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	NUP1	P20676	1076 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	DAL82	P21705	255 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	PPZ1	P26570	692 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	ADE1	P27616	306 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	ERG9	P29704	444 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	SKN1	P33336	771 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	CBP4	P37267	147 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
DDP1	YOR163W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86

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