RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	MUM3	Q08750	479 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PET20	Q99373	253 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	GDA1	P32621	518 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RAD24	P32641	659 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MNS1	P32906	549 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MSN2	P33748	704 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MRPS5	P33759	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YKL097C	P34245	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CTP1	P38152	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ATG7	P38862	630 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YJR154W	P47181	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SSN8	P47821	323 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	DXO1	Q06349	442 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NDE2	Q07500	545 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NAM2	P11325	894 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CTR86	P25355	563 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ELM1	P32801	640 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CSE1	P33307	960 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	FZO1	P38297	855 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IKI1	P38874	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YER184C	P39961	794 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RTT101	P47050	842 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YIP4	P53093	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YGR042W	P53227	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	OKP1	P53298	406 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CDC14	Q00684	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	DLT1	Q04216	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TMN2	Q04562	672 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	THI3	Q07471	609 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ALE1	Q08548	619 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TMS1	Q12116	473 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PER33	Q12144	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ATP6	P00854	259 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	DST1	P07273	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RAD57	P25301	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NAM9	P27929	486 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VMA22	P38784	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ICP55	P40051	511 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VRG4	P40107	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VEL1	P53058	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YPR003C	P53394	754 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YTP1	P53584	459 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YLR460C	P54007	376 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ASA1	Q06822	443 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PLB3	Q08108	686 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PUT1	P09368	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MRX3	P38172	270 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TRM5	P38793	499 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SEO1	P39709	593 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	HAT2	P39984	401 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PRM10	P42946	383 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CHA4	P43634	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SNX4	P47057	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	AZR1	P50080	613 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MGA1	P53050	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RIM8	P53179	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MKC7	P53379	596 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SLD5	Q03406	294 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	HSP31	Q04432	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	LDS2	Q08218	356 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MLH3	Q12083	715 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NPC2	Q12408	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RAS1	P01119	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	HIS5	P07172	385 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RPB8	P20436	146 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	FUB1	P25659	250 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	TOA2	P32774	122 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MRPL6	P32904	214 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	CAF4	P36130	643 aa		4.09	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.8 ms