RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RMD5	Q12508	421 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COA6	Q3E846	104 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FSH3	Q99369	266 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PET20	Q99373	253 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SPE1	P08432	466 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NAM2	P11325	894 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GAL2	P13181	574 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PER1	P25625	357 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERG9	P29704	444 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ACB1	P31787	87 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SRY1	P36007	326 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FLR1	P38124	548 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRE3	P38624	215 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ARN1	P38731	627 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PPE1	P38796	400 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRM10	P42946	383 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HXT10	P43581	546 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SSY5	P47002	699 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AIM22	P47051	409 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YJR012C	P47087	207 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MCM22	P47167	239 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RTA1	P53047	317 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGL138C	P53122	345 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGL101W	P53144	215 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YSA1	Q01976	231 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDC1	Q02896	317 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	RKM5	Q12367	367 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRX4	Q12467	430 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COX6	P00427	148 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERR1	P0CX10	437 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERR2	P0CX11	437 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRPL6	P32904	214 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TGL1	P34163	548 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TUL1	P36096	758 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FLO10	P36170	1169 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	APL3	P38065	1025 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	HSL7	P38274	827 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ICS2	P38284	255 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PEX28	P38848	579 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AIM46	P38885	310 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PAN6	P40459	309 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERR3	P42222	437 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NUP57	P48837	541 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NBP35	P52920	328 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SCW11	P53189	542 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HED1	Q03937	162 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SHH3	Q04487	196 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YML096W	Q04489	525 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SEN15	Q04675	128 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RIF2	Q06208	395 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HRD1	Q08109	551 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RRT8	Q08219	342 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TCO89	Q08921	799 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.43	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	REV1	P12689	985 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EHD3	P28817	500 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SKT5	P34226	696 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COS9	P36034	407 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PET10	P36139	283 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DTR1	P38125	572 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AME1	P38313	324 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PHO89	P38361	574 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SHU2	P38957	223 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	XDJ1	P39102	459 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	VPS52	P39904	641 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BUR6	P40096	142 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YJL171C	P46992	396 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DIA3	P52290	468 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGL185C	P53100	379 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TIM13	P53299	105 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	VPS9	P54787	451 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SPR6	Q01684	191 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PPN1	Q04119	674 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	IZH3	Q07959	543 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PPM2	Q08282	695 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RAD28	Q12021	506 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	SNF8	Q12483	233 aa		3.42	□□□□□ -1.86

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