RNA–Protein interactions for RNA: YPR163C

TIF3, Transcript of Translation initiation factor eIF-4B, yeast

Gene TIF3, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF3	YPR163C	GDS1	P41913	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	PRM10	P42946	383 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	ATG18	P43601	500 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RRN9	P53437	365 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RNH202	Q05635	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	PDR8	Q06149	701 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	YPQ2	Q06328	317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	VPS36	Q06696	566 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	YLR040C	Q07988	224 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RTT10	Q08924	1013 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	SUL2	Q12325	893 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	HMG1	P12683	1054 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	SNF6	P18888	332 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	ATG22	P25568	528 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	SUR1	P33300	382 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	SPT23	P35210	1082 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	MLH1	P38920	769 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	AIM2	P39721	246 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	FMC1	P40491	155 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	MNT3	P40549	630 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	MNN5	P46982	586 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	NBP35	P52920	328 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	MAL11	P53048	616 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	MNT4	P53745	580 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	COS1	P53822	381 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	ATG10	Q07879	167 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RKM5	Q12367	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	RTN2	Q12443	393 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TIF3	YPR163C	MSB2	P32334	1306 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	SEC2	P17065	759 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	DIT1	P21623	536 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	HSP30	P25619	332 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	HYM1	P32464	399 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	PPQ1	P32945	549 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	TOD6	P34219	525 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	TUL1	P36096	758 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YRO2	P38079	344 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YBR137W	P38276	179 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YFR020W	P43600	232 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	NUP57	P48837	541 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	TPN1	P53099	579 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	SGF73	P53165	657 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	NUP116	Q02630	1113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MSC1	Q03104	513 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	SYO1	Q07395	620 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	VPS68	Q12016	184 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	BAG7	Q12128	409 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	PCL9	Q12477	304 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YPR064W	Q12492	139 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MCM7	P38132	845 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	BNA4	P38169	460 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YBR242W	P38331	238 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	TAE1	P38340	232 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	PET100	P38958	111 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MET30	P39014	640 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MBP1	P39678	833 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	OSW5	P40219	148 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	RAD17	P48581	401 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	CWC24	P53769	259 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YLR173W	Q06247	608 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YOR114W	Q12219	294 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	RTR2	Q12378	196 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YOR019W	Q99248	730 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MDM35	O60200	86 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	RAS1	P01119	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YOL163W	P0CF20	169 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	APN1	P22936	367 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	AHC2	P25649	128 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	ADE1	P27616	306 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	ERG9	P29704	444 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	NTH1	P32356	751 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	PET112	P33893	541 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	SHE1	P38200	338 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	COS10	P52924	374 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	ATF2	P53296	535 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MEP3	P53390	489 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	MTQ1	P53944	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TIF3	YPR163C	YML108W	Q03759	105 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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