RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A SCH9P11792 824 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PTK1P36002 662 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data0.05□□□□□ -2.4not detected
YPL060C-AYPL060C-A ARC35P53731 342 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GPH1P06738 902 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A FUS3P16892 353 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A NIP100P33420 868 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CMC1P36064 111 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YHK8P38776 514 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YJL144WP47009 104 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PMT5P52867 743 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MFB1Q04922 465 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TRM3Q07527 1436 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MAS1P10507 462 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RED1P14291 827 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RIM1P32445 135 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MPE1P35728 441 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A OLA1P38219 394 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YIL012WP40551 113 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YJL055WP47044 245 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MTM1P53320 366 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A INP1Q03694 420 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A BNA5Q05979 453 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SPO77Q06134 477 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A VTA1Q06263 330 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SUE1Q06524 206 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PLB3Q08108 686 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YOR365CQ08844 703 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A VAM3Q12241 283 aa0.05□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ERD1P16151 362 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MIG1P27705 504 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RRP4P38792 359 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GGC1P38988 300 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CCH1P50077 2039 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GEA2P39993 1459 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A USO1P25386 1790 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PMD1P32634 1753 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A VTH1P40438 1549 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A VTH2P40890 1549 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CAP2P13517 287 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RPB5P20434 215 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A EXG1P23776 448 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YMR262WP38430 313 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RSM27P53305 110 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A FIN1Q03898 291 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A IPK1Q06667 281 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RRD2Q12461 358 aa0.04□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ADH1P00330 348 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CTA1P15202 515 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A BDH1P39714 382 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MPS2P53159 387 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GYL1Q04322 720 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A OPY2Q06810 360 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data0.03□□□□□ -2.4not detected
YPL060C-AYPL060C-A TRM8Q12009 286 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ORT1Q12375 292 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YBT1P32386 1661 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TY3B-GQ99315 1547 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CYC3P06182 269 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PDC2P32896 925 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TKL2P33315 681 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TRR2P38816 342 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A NOC2P39744 710 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PTI1P39927 425 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PUS4P48567 403 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TDA1Q03533 586 aa0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TPT1Q12272 230 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TAF2P23255 1407 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A CLC1P17891 233 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A TDA11P38854 504 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A LYS4P49367 693 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A CDH1P53197 566 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A BRE1Q07457 700 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A MED2Q12124 431 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A BUG1Q12191 341 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A UFD4P33202 1483 aa0.03□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A NUP159P40477 1460 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A ECM14P38836 430 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A MNL1P38888 796 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A FLC2P39719 783 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A RRT5P43607 289 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A MNN5P46982 586 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A YGL088WP53151 121 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A HRT1Q08273 121 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A YDL199CQ12407 687 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A MSS18P08593 268 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A TRX2P22803 104 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A PRD1P25375 712 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A SEC27P41811 889 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A ATG18P43601 500 aa0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A CTK3P46963 296 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
YPL060C-AYPL060C-A YGR067CP53243 804 aa0.02□□□□□ -2.41
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