RNA–Protein interactions for RNA: Q0142

Q0142, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0142, Length 177 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0142	Q0142	CPT1	P17898	393 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	COX10	P21592	462 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	LDS1	P31379	325 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	COS5	P47187	383 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	YGR117C	P53270	476 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	COS7	Q07788	383 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	YOL029C	Q08187	201 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	UNG1	P12887	359 aa		0.92	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	TPM2	P40414	161 aa		0.92	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	SHE1	P38200	338 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	YMR262W	P38430	313 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	MED6	P38782	295 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	YGR015C	P53208	328 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	FSH2	Q05015	223 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0142	Q0142	SSH4	P32343	579 aa		0.9	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GPX2	P38143	162 aa		0.9	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GPI16	P38875	610 aa		0.9	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	MET2	P08465	486 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	COS9	P36034	407 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	FUI1	P38196	639 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YDR131C	Q03899	556 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	API2	Q04413	109 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	URA4	P20051	364 aa		0.88	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	ATP16	Q12165	160 aa		0.88	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	CLB1	P24868	471 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GEP4	P38812	185 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	PCL7	P40186	285 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	CIN2	P46670	268 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YGL138C	P53122	345 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YPL080C	Q02826	108 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YMR010W	Q03687	405 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	APC4	Q04601	652 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	BRF1	P29056	596 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	SMF1	P38925	575 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YJR054W	P47114	497 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	CDH1	P53197	566 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	PRM1	P53835	661 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YDR056C	Q12025	205 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	VPS54	Q12071	889 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GGC1	P38988	300 aa		0.85	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GMC1	Q04399	608 aa		0.85	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.84	□□□□□ -2.27	not detected
Q0142	Q0142	TIR2	P33890	251 aa		0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GTO3	Q04806	366 aa		0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	GRX6	Q12438	231 aa		0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	RTN2	Q12443	393 aa		0.84	□□□□□ -2.27
Q0142	Q0142	ARG3	P05150	338 aa		0.83	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	KRE1	P17260	313 aa		0.83	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	NAS6	P50086	228 aa		0.83	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	DST1	P07273	309 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	DAL81	P21657	970 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	VID27	P40157	782 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	ROG1	P53118	685 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	YPR063C	Q12160	140 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	CLC1	P17891	233 aa		0.81	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	COX3	P00420	269 aa		0.8	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	KAP120	Q02932	1032 aa		0.8	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	YOP1	Q12402	180 aa		0.8	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	ROX1	P25042	368 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	ASG7	P46993	209 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	SLT2	Q00772	484 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	SKO1	Q02100	647 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	YDR114C	Q04597	100 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	PEX30	Q06169	523 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	HEM4	P06174	275 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	TIP20	P33891	701 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	PIB2	P53191	635 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	OCA2	P53949	197 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	ARR1	Q06596	294 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0142	Q0142	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	RRN9	P53437	365 aa		0.76	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	YDR222W	Q04925	415 aa		0.76	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	ERG3	P32353	365 aa		0.75	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.75	□□□□□ -2.29	not detected
Q0142	Q0142	YCH1	P42937	148 aa		0.75	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	STE24	P47154	453 aa		0.75	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
Q0142	Q0142	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms