RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W FDH1Q08911 376 aa8.78□□□□□ -1
BRR1YPR057W TFS1P14306 219 aa8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W PRP39P39682 629 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SWP82P43554 623 aa8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YGR168CP53293 376 aa8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W GRX5Q02784 150 aa8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YOR019WQ99248 730 aa8.77□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SIR3P06701 978 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W THR1P17423 357 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CDC12P32468 407 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W HOG1P32485 435 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W MSN2P33748 704 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CTF8P38877 133 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W TAT2P38967 592 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RRG9P40156 214 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RPS12P48589 143 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SHE4P51534 789 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W VPS36Q06696 566 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W FMP45Q07651 309 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W NTG2Q08214 380 aa8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ENA1P13587 1091 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CBS1P14066 229 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W HOP1P20050 605 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CHA1P25379 360 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YRO2P38079 344 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YPS6P40583 537 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W IBA57P47158 497 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W AAD10P47182 288 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W NUP57P48837 541 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W IMD4P50094 524 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W MPC1P53157 130 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ENA2Q01896 1091 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YSA1Q01976 231 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RNH1Q04740 348 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W STP3Q05937 343 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W MCM21Q06675 368 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YEH1Q07804 573 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ENA5Q12691 1091 aa8.75□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YOL163WP0CF20 169 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SAM35P14693 329 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CLB2P24869 491 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W PRP19P32523 503 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W HBS1P32769 611 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SBE22P38814 852 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W LTP1P40347 161 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W FET5P43561 622 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RET2P43621 546 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W HMS2P47175 358 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RIM21P48565 533 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ASI1P54074 624 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W NAT4Q04751 285 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W GIC2Q06648 383 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W MSH5Q12175 901 aa8.74□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W MOD5P07884 428 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W AAC3P18238 307 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YCK1P23291 538 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ITR2P30606 609 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YPK3P38070 525 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W GIP2P40036 548 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W EFM3P47163 339 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W MEP3P53390 489 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ABZ2Q03266 374 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W GAL83Q04739 417 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W BNA5Q05979 453 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YLR030WQ07967 263 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SIA1Q12212 622 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RKM5Q12367 367 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W PNS1Q12412 539 aa8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W IDP1P21954 428 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CWP1P28319 239 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W OAC1P32332 324 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W HIR2P32480 875 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YOR062CP36025 268 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W TRR2P38816 342 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W GID8P40208 455 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W ALR2P43553 858 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W CHA4P43634 648 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W NEJ1Q06148 342 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YLR446WQ06204 433 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YDL114WQ07530 308 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YDL129WQ07555 291 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W GSH2Q08220 491 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W YOR389WQ08912 624 aa8.72□□□□□ -1.01
BRR1YPR057W REP1P03871 373 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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