RNA–Protein interactions for RNA: YNL146W

YNL146W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL146W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL146W	YNL146W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	LDS2	Q08218	356 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	IMA2	Q08295	589 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	ENT1	Q12518	454 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	SCEI	P03882	235 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	ECM8	P38246	354 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	URH1	Q04179	340 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	HSP42	Q12329	375 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	GEX1	P25596	615 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	GPI10	P30777	616 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	TKL2	P33315	681 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	BIO3	P50277	480 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	ASA1	Q06822	443 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	MMS4	P38257	691 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	HEM14	P40012	539 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	FMS1	P50264	508 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	VAM3	Q12241	283 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	LDB17	Q12342	491 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	CKA2	P19454	339 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	MET18	P40469	1032 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	KEG1	P43614	200 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	VAC7	P53950	1165 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	STD1	Q02794	444 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	MSC3	Q05812	728 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	PLB3	Q08108	686 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	FRE8	Q12209	686 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RRN10	P38204	145 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	TPM2	P40414	161 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	SPO22	P40511	975 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	JJJ1	P53863	590 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	POM152	P39685	1337 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	FLO11	P08640	1367 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	MIG1	P27705	504 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	SKT5	P34226	696 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	FUI1	P38196	639 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	RMI1	Q02685	241 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	VTI1	Q04338	217 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL146W	YNL146W	YBR241C	P38142	488 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	VHS2	P40463	436 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	YGL088W	P53151	121 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	MMT1	Q03218	510 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	CDD1	Q06549	142 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	RNH201	P53942	307 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	YMR155W	Q03795	547 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	VTA1	Q06263	330 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	BUG1	Q12191	341 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	SPO23	P33757	523 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	UFE1	P41834	346 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	MRX11	Q03079	207 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	SFM1	Q12314	213 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	SSH4	P32343	579 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	COG4	Q06096	861 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	HMS1	Q12398	434 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	PCL9	Q12477	304 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	ANP1	P32629	500 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	BDH1	P39714	382 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	COS5	P47187	383 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	SPR6	Q01684	191 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	COS7	Q07788	383 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	YDR056C	Q12025	205 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	HIF1	Q12373	385 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.78	□□□□□ -2.28	not detected
YNL146W	YNL146W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	MNN5	P46982	586 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	YOL029C	Q08187	201 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YNL146W	YNL146W	ALG1	P16661	449 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YNL146W	YNL146W	YKR032W	P36127	104 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YNL146W	YNL146W	GPX2	P38143	162 aa		0.77	□□□□□ -2.29

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.9 ms