RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	INN1	P53901	409 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	SEI1	Q06058	285 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	RXT3	Q07458	294 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	YEH1	Q07804	573 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	RCN2	Q12044	265 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	GET4	Q12125	312 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	NTO1	Q12311	748 aa		5.97	□□□□□ -1.45
DRE2	YKR071C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ERG8	P24521	451 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ERG9	P29704	444 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	DEP1	P31385	405 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SET3	P36124	751 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YIL169C	P40442	995 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RPE1	P46969	238 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	AIM22	P47051	409 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	APS3	P47064	194 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	URB2	P47108	1174 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	CDH1	P53197	566 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	TPC1	P53257	314 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MKC7	P53379	596 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RCF2	P53721	224 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ATP25	Q03153	612 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.96	□□□□□ -1.46	not detected
DRE2	YKR071C	MDM12	Q92328	271 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	FLO9	P39712	1322 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MAK32	P23060	363 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	OCA4	P25366	362 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SHR5	P41912	237 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	FAR3	P46671	204 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YLR460C	P54007	376 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YPL107W	Q02873	248 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	USA1	Q03714	838 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SFH1	Q06168	426 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YPR091C	Q06833	770 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	VHS3	Q08438	674 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YOR365C	Q08844	703 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MTR10	Q99189	972 aa		5.95	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ALG7	P07286	448 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	STE12	P13574	688 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SSO1	P32867	290 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RIM2	P38127	377 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PZF1	P39933	429 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MET18	P40469	1032 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YGR079W	P53249	370 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SLM2	P53955	656 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RHO4	Q00246	291 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PFA5	Q03289	374 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	GAS2	Q06135	555 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YLR446W	Q06204	433 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YOS9	Q99220	542 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		5.94	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ATS1	P31386	333 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YBR062C	P38239	180 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	COS111	P38308	924 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	AIM2	P39721	246 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SOK1	P40317	901 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	XBP1	P40489	647 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YPL071C	Q02864	156 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YMR102C	Q03177	834 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PLB2	Q03674	706 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	GIS1	Q03833	894 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	GMC2	Q06201	188 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YPR172W	Q06608	200 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PSF1	Q12488	208 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	YOL087C	Q99247	1116 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.93	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ATP4	P05626	244 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SPS100	P13130	326 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	CBS2	P14905	389 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	RPB5	P20434	215 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	MAD3	P47074	515 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PGU1	P47180	361 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	KEL2	P50090	882 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	PLM2	Q04383	521 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SMA2	Q04658	369 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	FDH1	Q08911	376 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DRE2	YKR071C	SKS1	Q12505	502 aa		5.92	□□□□□ -1.46

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms