RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YIP5	P53108	310 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ALF1	P53904	254 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ARP5	P53946	755 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YDR541C	Q03049	344 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	VPS20	Q04272	221 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	MSC3	Q05812	728 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SGT1	Q08446	395 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YRM1	Q12340	786 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PUT4	P15380	627 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ALG1	P16661	449 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	LSB5	P25369	354 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RDS1	P25611	832 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	VPS45	P38932	577 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	STN1	P38960	494 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ROG1	P53118	685 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	MPS2	P53159	387 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PRM1	P53835	661 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YLH47	Q06493	454 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SOR2	Q07786	357 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	FDH1	Q08911	376 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CEX1	Q12453	761 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CYC3	P06182	269 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RRN10	P38204	145 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	MNL1	P38888	796 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RPN14	P53196	417 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	IPK1	Q06667	281 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SRN2	Q99176	213 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	VPS63	O13549	108 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	NAM2	P11325	894 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SAG1	P20840	650 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PSO2	P30620	661 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CSE2	P33308	149 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	STP2	P38704	541 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SSO2	P39926	295 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	BRO1	P48582	844 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	AZR1	P50080	613 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PHB2	P50085	310 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	STE23	Q06010	1027 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	GAL7	P08431	366 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	NUP2	P32499	720 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	IME2	P32581	645 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
SFT1	YKL006C-A	YSC83	P32792	385 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	QDR3	P38227	689 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	GAT2	P40209	560 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YFR018C	P43599	363 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PHO86	P46956	311 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PIB2	P53191	635 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	APJ1	P53940	528 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RNH1	Q04740	348 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CUR1	Q06469	252 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RUP1	Q12242	671 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YOR012W	Q12351	137 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	IMA3	P0CW40	589 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	IMA4	P0CW41	589 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
SFT1	YKL006C-A	PET18	P25362	215 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	KAR9	P32526	644 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	MRP21	P38175	177 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	INM1	P38710	295 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YHR177W	P38867	453 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	YPS6	P40583	537 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	MTQ1	P53944	314 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	NUP116	Q02630	1113 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	GIP3	Q03016	1276 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	TSA2	Q04120	196 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	ECM18	Q04623	453 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	NSE1	Q07913	336 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	IMA2	Q08295	589 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	RMD5	Q12508	421 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFT1	YKL006C-A	CDC21	P06785	304 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	CTR86	P25355	563 aa		2.65	□□□□□ -1.99

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