RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	HOM3	P10869	527 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MAS2	P11914	482 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RED1	P14291	827 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	URA4	P20051	364 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CLB3	P24870	427 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PFF1	P38244	976 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SEC9	P40357	651 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YFL012W	P43580	148 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	KTR6	P54070	446 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	KAP120	Q02932	1032 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MCH1	Q07376	486 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YDL121C	Q07541	149 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PUT4	P15380	627 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DEP1	P31385	405 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PRY2	P36110	329 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MMS4	P38257	691 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	WSS1	P38838	269 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CHL4	P38907	458 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YER184C	P39961	794 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MMT1	Q03218	510 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ACL4	Q03771	387 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YMR130W	Q04223	302 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DON1	Q05610	365 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DCS1	Q06151	350 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	LOT6	Q07923	191 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YDR061W	Q12298	539 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CEX1	Q12453	761 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CMK2	P22517	447 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	BRF1	P29056	596 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	FUN26	P31381	517 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	IME2	P32581	645 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YEF1	P32622	495 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	COX13	P32799	129 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CYM1	P32898	989 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	HEL1	P36113	551 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	FHL1	P39521	936 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	GAT2	P40209	560 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	NDE1	P40215	560 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TOM22	P49334	152 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TOS2	P50078	622 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	VHT1	P53241	593 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YPL107W	Q02873	248 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PRM6	Q04705	352 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ROY1	Q04847	553 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MMR1	Q06324	491 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YDL114W	Q07530	308 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	FCY22	Q12119	530 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MCT1	Q12283	360 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YDL199C	Q12407	687 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PAN1	P32521	1480 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ALG1	P16661	449 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YCR051W	P25631	222 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MSP1	P28737	362 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AGA2	P32781	87 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RCK2	P38623	610 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HEM14	P40012	539 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	KEG1	P43614	200 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YGR067C	P53243	804 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YGR117C	P53270	476 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ALF1	P53904	254 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YPR195C	Q06594	109 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YOL085C	Q99345	113 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
NNF2	YGR089W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DST1	P07273	309 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PDC2	P32896	925 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SKN1	P33336	771 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GPX2	P38143	162 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SLM4	P38247	162 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GPI16	P38875	610 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SSN2	P38931	1420 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CPR7	P47103	393 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DIA1	P54005	336 aa		0.46	□□□□□ -2.34

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