RNA–Protein interactions for RNA: YMR309C

NIP1, Transcript of eIF3c subunit of the eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3), yeast

Gene NIP1, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NIP1	YMR309C	HMS1	Q12398	434 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RAX2	Q12465	1220 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MRP7	P12687	371 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SEC63	P14906	663 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PUT4	P15380	627 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CLC1	P17891	233 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	DEP1	P31385	405 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SOL2	P37262	315 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RCK2	P38623	610 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	WSS1	P38838	269 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PEX22	P39718	180 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YAL037W	P39728	267 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PHO86	P46956	311 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	BNS1	P50084	137 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YGR018C	P53211	109 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	JJJ1	P53863	590 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	STD1	Q02794	444 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TDA1	Q03533	586 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YPR195C	Q06594	109 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	BUG1	Q12191	341 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ATG34	Q12292	412 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CEX1	Q12453	761 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SCEI	P03882	235 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	IMA3	P0CW40	589 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	IMA4	P0CW41	589 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MAS2	P11914	482 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CAP2	P13517	287 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	URA4	P20051	364 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CMK2	P22517	447 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	BRF1	P29056	596 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ZIP1	P31111	875 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	IME2	P32581	645 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YEF1	P32622	495 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YME2	P32843	850 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SAS3	P34218	831 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	DTR1	P38125	572 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YIR035C	P40579	254 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	COS5	P47187	383 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	VEL1	P53058	206 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SPR6	Q01684	191 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SKO1	Q02100	647 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MMT1	Q03218	510 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YMR130W	Q04223	302 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YDR115W	Q04598	105 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	COS7	Q07788	383 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	IMA2	Q08295	589 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	POM152	P39685	1337 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	STE7	P06784	515 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	DST1	P07273	309 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RED1	P14291	827 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CKA1	P15790	372 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	EPT1	P22140	391 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PHA2	P32452	334 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ECM34	P38728	170 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	FRT2	P39734	528 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TOS3	P43637	560 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MRPL19	P53875	158 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	DIA1	P54005	336 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MDM30	Q05930	598 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	DCS1	Q06151	350 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MFG1	Q07684	458 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YPR096C	O13587	100 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	CDC21	P06785	304 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	YBR241C	P38142	488 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	RFC3	P38629	340 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	YHK8	P38776	514 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	PIB2	P53191	635 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	OCA2	P53949	197 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	YDR131C	Q03899	556 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	DON1	Q05610	365 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	FCY22	Q12119	530 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	MED1	Q12321	566 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	GRX6	Q12438	231 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NIP1	YMR309C	RTN2	Q12443	393 aa		0.4	□□□□□ -2.35

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