RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GPM2	Q12008	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ATG9	Q12142	997 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SEY1	Q99287	776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RIP1	P08067	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PDE1	P22434	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	BCS1	P32839	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YER130C	P39959	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YKE4	P40544	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	BAP3	P41815	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YPT11	P48559	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	TAF6	P53040	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPC98	P53540	846 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YIP3	P53633	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YDC1	Q02896	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SHS1	Q07657	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AAD15	Q08361	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DAP1	Q12091	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	HIS5	P07172	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	WHI2	P12611	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CDC20	P26309	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	KRE2	P27809	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
HOF1	YMR032W	NUF2	P33895	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FIG1	P38224	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
HOF1	YMR032W	MRX5	P47007	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YDL186W	P48568	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YGL117W	P53133	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FHN1	P53279	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MRPL50	P53724	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	TRM11	Q12463	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ERG9	P29704	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPT10	P35208	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ATG27	P46989	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CTF19	Q02732	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MSC1	Q03104	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	NRG1	Q03125	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PEX12	Q04370	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPC24	Q04477	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DUS4	Q06063	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CDA2	Q06703	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RRI1	Q12468	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RBK1	P25332	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DTR1	P38125	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	BMT2	P38278	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	VHC1	P38329	1120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SDH8	P38345	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	UIP3	P39547	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YNL194C	P40169	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AGP3	P43548	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PRY1	P47032	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MSY1	P48527	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPT20	P50875	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SLG1	P54867	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	COQ11	Q05892	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	NPC2	Q12408	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YPR1	Q12458	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	COX1	P00401	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CKI1	P20485	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
HOF1	YMR032W	GAC1	P28006	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RGT1	P32862	1170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MBB1	P39534	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SNL1	P40548	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YIR016W	P40572	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	NPA3	P47122	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ERG5	P54781	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GCN5	Q03330	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	BUR2	Q05949	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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