RNA–Protein interactions for RNA: YKL018W

SWD2, Transcript of Subunit of the COMPASS (Set1C) histone H3K4 methyltransferase complex, yeast

Gene SWD2, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SWD2	YKL018W	QDR3	P38227	689 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	HSM3	P38348	480 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.23	□□□□□ -1.89	not detected
SWD2	YKL018W	NAS2	P40555	220 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	PAC11	P40960	533 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	AGX1	P43567	385 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	GWT1	P47026	490 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	PHB2	P50085	310 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	SHE4	P51534	789 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	YNR068C	P53754	272 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	BOR1	P53838	576 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	YNL143C	P53908	130 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	GPI15	P53961	229 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	NSE1	Q07913	336 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	SGT1	Q08446	395 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	CTR86	P25355	563 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	YBL028C	P38202	106 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	YHR131C	P38835	850 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	YAL037W	P39728	267 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	COS10	P52924	374 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	FRE4	P53746	719 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	PRM1	P53835	661 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	IPK1	Q06667	281 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	TLG2	Q08144	397 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	IMA2	Q08295	589 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	AYT1	Q12226	474 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	ATG34	Q12292	412 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SWD2	YKL018W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	CHS1	P08004	1131 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	PPQ1	P32945	549 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
SWD2	YKL018W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	YPS6	P40583	537 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	YPI1	P43587	155 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	YGL242C	P53066	181 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	ODC1	Q03028	310 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SNZ1	Q03148	297 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MMT1	Q03218	510 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RSN1	Q03516	953 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	BET5	Q03630	159 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MGR3	Q04472	501 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MUM3	Q08750	479 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	BUD4	P47136	1447 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	STE3	P06783	470 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	LSB5	P25369	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SUR1	P33300	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SRB2	P34162	210 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	STP2	P38704	541 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	CTM1	P38818	585 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	PEX18	P38855	283 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SPT8	P38915	602 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SHO1	P40073	367 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	OSW5	P40219	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SSN8	P47821	323 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	POP6	P53218	158 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	STD1	Q02794	444 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MRP51	Q02950	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	URH1	Q04179	340 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MDM36	Q06820	579 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MDY2	Q12285	212 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	ORT1	Q12375	292 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RDS1	P25611	832 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	NTG1	P31378	399 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	KDX1	P36005	433 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	PMU1	P36069	295 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MSG5	P38590	489 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	ALG8	P40351	577 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	IDP2	P41939	412 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	AVT4	P50944	713 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	NUP84	P52891	726 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	MPS2	P53159	387 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	HOP2	P53187	214 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RTT102	P53330	157 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	RRN5	Q02983	363 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SWD2	YKL018W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9

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