RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W GAL80P04387 435 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W ITR2P30606 609 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W TFB1P32776 642 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W YPT53P36019 220 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W RIM2P38127 377 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W CST26P38226 397 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W PHO89P38361 574 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W EMC2P47133 292 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W LSC1P53598 329 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W CIK1Q01649 594 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W ECM30Q06673 1274 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W YOR342CQ12182 319 aa4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PRD1YCL057W GCN3P14741 305 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W PDA1P16387 420 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W CDC42P19073 191 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SLY1P22213 666 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W TRX1P22217 103 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W CYM1P32898 989 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W KAP104P38217 918 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W MUM2P38236 366 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W ICS2P38284 255 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W GAT1P43574 510 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YFL012WP43580 148 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W IPI3P53877 555 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W TVP15Q03860 143 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W GPI17Q04080 534 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W FMP42Q04991 504 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W COA4Q05809 96 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SEC10Q06245 871 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W CUR1Q06469 252 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data4.52□□□□□ -1.69not detected
PRD1YCL057W SNF4P12904 322 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RED1P14291 827 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RPB8P20436 146 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W TMT1P32643 299 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RPL32P38061 130 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SCC4P40090 624 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SED5Q01590 340 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YMR160WQ03823 816 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W MRPL1Q04599 285 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W COQ9Q05779 260 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W HER1Q12276 1246 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W HRT3Q12347 344 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa4.52□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W STE2D6VTK4 431 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W ELO2P25358 347 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RME1P32338 300 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YBL028CP38202 106 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W VID24P38263 362 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W PCL6P40038 420 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W FIS1P40515 155 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W PET130P47065 347 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W REX2P54964 269 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YDL218WQ07629 317 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W LDB17Q12342 491 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RTN2Q12443 393 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RPS3P05750 240 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W CBP1P07252 654 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W MEI4P29467 408 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RCN1P36054 211 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W STV1P37296 890 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YBR285WP38354 144 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W GND1P38720 489 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W AST2P39945 430 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W AVT6P40074 448 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W DSL1P53847 754 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W NUP100Q02629 959 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YML122CQ03207 126 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SPC19Q03954 165 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W UIP4Q08926 304 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W PSY3Q12318 242 aa4.51□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RHO1P06780 209 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W BRF1P29056 596 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W HXT3P32466 567 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W PEX5P35056 612 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SCO2P38072 301 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YBR139WP38109 508 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W LSM5P40089 93 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YRB2P40517 327 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W TWF1P53250 332 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W SOL4P53315 255 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W IZH1Q03419 316 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W DYN3Q04949 312 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W LOT6Q07923 191 aa4.5□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W IMA3P0CW40 589 aa4.49□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W IMA4P0CW41 589 aa4.49□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W TCP1P12612 559 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PRD1YCL057W PTC1P35182 281 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.4 ms