RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)A

SUP56, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP56, Length 82 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP56tL(CAA)A RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A URA7P28274 579 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MSN2P33748 704 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A HES1P35843 434 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A DOA1P36037 715 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MNN2P38069 597 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A TRR2P38816 342 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A VHR1P40522 640 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YRB1P41920 201 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MPS3P47069 682 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MAD3P47074 515 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RTA1P53047 317 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A SHY1P53266 389 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A HST2P53686 357 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A HAP5Q02516 242 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A SMA2Q04658 369 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A DCR2Q05924 578 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A ACM1Q08981 209 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A PSF1Q12488 208 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A Q0010Q9ZZX9 128 aa3.36□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A CDC4P07834 779 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A CBF1P17106 351 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A AMS1P22855 1083 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RAD51P25454 400 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A DAL80P26343 269 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RPN12P32496 274 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A CYS4P32582 507 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YKL100CP34248 587 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A ICS2P38284 255 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YBR220CP38318 560 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A HSM3P38348 480 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YHL012WP38709 493 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YER010CP40011 234 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YER034WP40022 185 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A APS3P47064 194 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A PCP1P53259 346 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A HAS1Q03532 505 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A CSN9Q03981 162 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A SWF1Q04629 336 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A COQ11Q05892 277 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YPR091CQ06833 770 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A COS7Q07788 383 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RSC58Q07979 502 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YOR223WQ12015 292 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RTR2Q12378 196 aa3.35□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A FLP1P03870 423 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A ALG7P07286 448 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YML002WP0CF17 737 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A SPO7P18410 259 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A PHO87P25360 923 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A ECM14P38836 430 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A ECM10P39987 644 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YIL067CP40514 678 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A IDP2P41939 412 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MIC19P43594 170 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YPT32P51996 222 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A APJ1P53940 528 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RPM2Q02773 1202 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RSM28Q03430 361 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YPR172WQ06608 200 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A RUD3Q12234 484 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A YLL054CQ12244 843 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A MDY2Q12285 212 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A SET6Q12529 373 aa3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SUP56tL(CAA)A GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A GCR1P07261 785 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A AAC3P18238 307 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A SAN1P22470 610 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A YCL049CP25577 312 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A CWH43P25618 953 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A ITR1P30605 584 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A VPS51P36116 164 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A BMT2P38278 337 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A COS111P38308 924 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A POP4P38336 279 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A ANS1P38832 159 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A YEN1P40028 759 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A SHO1P40073 367 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A EFM4P40516 257 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A YIL001WP40560 513 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A SLS1P42900 643 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A PEF1P53238 335 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A RHO4Q00246 291 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A SKO1Q02100 647 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A INP1Q03694 420 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP56tL(CAA)A MRPL1Q04599 285 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.6 ms