RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SPO7P18410 259 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SLY1P22213 666 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SPS22P25380 463 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TOM22P49334 152 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YGR111WP53265 400 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GPI15P53961 229 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CIK1Q01649 594 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RSN1Q03516 953 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TAF12Q03761 539 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C BUG1Q12191 341 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YLR108CQ12259 485 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RMD5Q12508 421 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MTR10Q99189 972 aa1.64□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C COX3P00420 269 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ARO3P14843 370 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C KKQ8P36004 724 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YAL037WP39728 267 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C VHS2P40463 436 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C WWM1P43582 211 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C NCA3P46955 337 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C HXT11P54862 567 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YMR181CQ03231 154 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PPM1Q04081 328 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GYL1Q04322 720 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C AEP3Q12089 606 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GPM3Q12326 303 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ADE4P04046 510 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SPO12P17123 173 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C HEL1P36113 551 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ASC1P38011 319 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YBR137WP38276 179 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TOF1P53840 1238 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C OAZ1Q02803 292 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YMR027WQ04371 470 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C DCI1Q08558 271 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C UAF30Q08747 228 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SNX3Q08826 162 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C FDH1Q08911 376 aa1.63□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RAD57P25301 460 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C NIP1P32497 812 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C LTV1P34078 463 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PEX5P35056 612 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C LRP1P38801 184 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PCF11P39081 626 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PRM5P40476 318 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C LCB2P40970 561 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data1.62□□□□□ -2.15not detected
HDA3YPR179C AZR1P50080 613 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YLR456WQ06199 204 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SRL2Q12020 392 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SPE3Q12074 293 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ATG34Q12292 412 aa1.62□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C IMA3P0CW40 589 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C IMA4P0CW41 589 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MNE1P24720 663 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RIM1P32445 135 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MUD1P32605 298 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C FAD1P38913 306 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YPS6P40583 537 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C URH1Q04179 340 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C IMA2Q08295 589 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YDL012CQ12489 107 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RVS161P25343 265 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YBR056WP38081 501 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C OLA1P38219 394 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GAT2P40209 560 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PAN6P40459 309 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C EFM4P40516 257 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YJL055WP47044 245 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SHY1P53266 389 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C VPS9P54787 451 aa1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PAR32Q12515 295 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TRP1P00912 224 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PET123P17558 318 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CYS4P32582 507 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C STN1P38960 494 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YER079WP40052 210 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SFH5P47008 294 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PIB2P53191 635 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MTM1P53320 366 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RHO5P53879 331 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C STD1Q02794 444 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C HER2Q03557 464 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C BCH1Q05029 724 aa1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CYC3P06182 269 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PDE2P06776 526 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CDC21P06785 304 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C DST1P07273 309 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
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