RNA–Protein interactions for RNA: YNR070W

PDR18, Transcript of Putative transporter of the ATP-binding cassette (ABC) family, yeast

Gene PDR18, Length 4,002 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR18	YNR070W	YJL045W	P47052	634 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	PIR3	Q03180	325 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	AIM32	Q04689	311 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	SSK1	Q07084	712 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	YOL159C	Q08300	171 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	PEX27	Q08580	376 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	YIG1	Q08956	461 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	FLC1	Q08967	793 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	UPC2	Q12151	913 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	YDR262W	Q12331	272 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PDR18	YNR070W	MDM35	O60200	86 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SNF6	P18888	332 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PTP2	P29461	750 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	ATG14	P38270	344 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	AIM22	P47051	409 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	HOC1	P47124	396 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PRM1	P53835	661 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SPP1	Q03012	353 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	TPP1	Q03796	238 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	BNA5	Q05979	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	CRT10	Q08226	957 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YCK1	P23291	538 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	FUN26	P31381	517 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SKG1	P36169	355 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YBR032W	P38223	100 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	ELO1	P39540	310 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	IES5	P40060	125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	AAD14	P42884	376 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	RRN9	P53437	365 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SWP1	Q02795	286 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PIR1	Q03178	341 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PEX10	Q05568	337 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	RIM15	P43565	1770 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	TEC1	P18412	486 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	TSR4	P25040	408 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	BRR6	P53062	197 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SRL4	Q03085	281 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	NAT4	Q04751	285 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MLC2	Q06580	163 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YOR342C	Q12182	319 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	TRX3	P25372	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	URK1	P27515	501 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PEX18	P38855	283 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	HPA3	P39979	161 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MEP1	P40260	492 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	AIM25	P47140	327 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	GAL4	P04386	881 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MRPL9	P31334	269 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	RSM22	P36056	628 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SER2	P42941	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	OAZ1	Q02803	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YLR031W	Q07978	186 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	GCN4	P03069	281 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	CWP1	P28319	239 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MSN2	P33748	704 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MNL1	P38888	796 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MLH1	P38920	769 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MNN1	P39106	762 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YJL055W	P47044	245 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MDE1	P47095	244 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	BBP1	Q12365	385 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	NIC96	P34077	839 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YPL068C	Q02749	293 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	TLG1	Q03322	224 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	REX4	Q08237	289 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	PSF1	Q12488	208 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	SPT23	P35210	1082 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	ECM34	P38728	170 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	NPR1	P22211	790 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	COS10	P52924	374 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	GIP3	Q03016	1276 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	FMN1	Q03778	218 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	RAD30	Q04049	632 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	MDM32	Q12171	622 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YOR019W	Q99248	730 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PDR18	YNR070W	YPR117W	Q06116	2489 aa		5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms