RNA–Protein interactions for RNA: YML049C

RSE1, Transcript of Protein involved in pre-mRNA splicing, yeast

Gene RSE1, Length 4,086 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSE1	YML049C	RSC3	Q06639	885 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	PUS9	Q12069	462 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	HCS1	P34243	683 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	YHL012W	P38709	493 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	HAT2	P39984	401 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	GCD10	P41814	478 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	ACS1	Q01574	713 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	VAM6	Q07468	1049 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	TSC13	Q99190	310 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSE1	YML049C	GPA2	P10823	449 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	AST1	P35183	429 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	MPM1	P40364	252 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	QDR1	P40475	563 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -2	not detected
RSE1	YML049C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	MPS2	P53159	387 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	SPR28	Q04921	423 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	GAS2	Q06135	555 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	BDS1	Q08347	646 aa		2.59	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	DAP2	P18962	818 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	CLN2	P20438	545 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YCR099C	P25657	155 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	SKG1	P36169	355 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	ACO2	P39533	789 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YDL186W	P48568	277 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	PFA5	Q03289	374 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	APC4	Q04601	652 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	BCH1	Q05029	724 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YLR352W	Q06479	807 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RDR1	Q08904	546 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	ADE1	P27616	306 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	TIP20	P33891	701 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	BET3	P36149	193 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	OMA1	P36163	345 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	VHR1	P40522	640 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RMI1	Q02685	241 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YOL131W	Q08270	108 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	NUS1	Q12063	375 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
RSE1	YML049C	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	DBF20	P32328	564 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	STP2	P38704	541 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	PKP1	P40530	394 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	UBP2	Q01476	1272 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RAD34	Q06665	692 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	SIA1	Q12212	622 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	MRP13	P12686	339 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YMC1	P32331	307 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	PHA2	P32452	334 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	TPO5	P36029	618 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	CAF4	P36130	643 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	IST2	P38250	946 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	ECM10	P39987	644 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	AVT7	P40501	490 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	MAM33	P40513	266 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	CIN1	P40987	1014 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	ATG36	P46983	293 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YMR210W	Q03649	449 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	PUN1	Q06991	263 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	GET4	Q12125	312 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	BMT6	Q12291	365 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	LDB17	Q12342	491 aa		2.58	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	COR1	P07256	457 aa		2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YCL068C	P25593	260 aa		2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RIB1	P38066	345 aa		2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	MRP21	P38175	177 aa		2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	RRN10	P38204	145 aa		2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	YTA6	P40328	754 aa		2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RSE1	YML049C	MTQ1	P53944	314 aa		2.57	□□□□□ -2

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