RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	HAC1	P41546	238 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SFH5	P47008	294 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	AIM24	P47127	394 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MRM2	P53123	320 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CLD1	P53264	445 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RGM1	Q00453	211 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VTI1	Q04338	217 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TAP42	Q04372	366 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	NMD4	Q12129	218 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SKM1	Q12469	655 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YOR338W	Q99326	363 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	STE7	P06784	515 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CTR86	P25355	563 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CHS3	P29465	1165 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SIN4	P32259	974 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SLC1	P33333	303 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	NIP100	P33420	868 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YHR054C	P38780	354 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PFS1	P38872	237 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PEX22	P39718	180 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	LCB3	P47013	409 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	UBX4	P54730	416 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	BET5	Q03630	159 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	INP2	Q03824	705 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MDM36	Q06820	579 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	LOT6	Q07923	191 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SMC5	Q08204	1093 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	LDS2	Q08218	356 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SRL2	Q12020	392 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	AVL9	Q12500	764 aa		0.13	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SEC63	P14906	663 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SPO12	P17123	173 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YCL068C	P25593	260 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ZIP1	P31111	875 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	COX13	P32799	129 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MRE11	P32829	692 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	FLC2	P39719	783 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MAM33	P40513	266 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YIL059C	P40520	121 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.12	□□□□□ -2.39	not detected
EST1	YLR233C	SAP185	P40856	1058 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SAS2	P40963	338 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	HMS2	P47175	358 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YGR021W	P53212	290 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YGR066C	P53242	292 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	NGL3	Q03210	505 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TDA1	Q03533	586 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DDC1	Q08949	612 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	FRE8	Q12209	686 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YLR278C	Q05854	1341 aa		0.12	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	GAL80	P04387	435 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CKA2	P19454	339 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CMK2	P22517	447 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RAD14	P28519	371 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MSP1	P28737	362 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	AFG1	P32317	509 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TFB1	P32776	642 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PDC2	P32896	925 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TKL2	P33315	681 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SMP1	P38128	452 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RFC3	P38629	340 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ECM34	P38728	170 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ESL1	P40456	1118 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VTC2	P43585	828 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MNN5	P46982	586 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	GPI15	P53961	229 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	GTR1	Q00582	310 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YLR345W	Q06137	509 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YDL114W	Q07530	308 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	REX4	Q08237	289 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SEC39	Q12745	709 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	AUS1	Q08409	1394 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RIP1	P08067	215 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SEC66	P33754	206 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RRN3	P36070	627 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21 ms