RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	DCS1	Q06151	350 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RPO31	P04051	1460 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SIN3	P22579	1536 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	HIR3	P47171	1648 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CLB1	P24868	471 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MRPL4	P36517	319 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SLM4	P38247	162 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	PAN6	P40459	309 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	AZR1	P50080	613 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MEH1	Q02205	184 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	HOT1	Q03213	719 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TAF2	P23255	1407 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	BUD4	P47136	1447 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MET5	P47169	1442 aa		2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CLN3	P13365	580 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SPO12	P17123	173 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	OPI1	P21957	404 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	DBF4	P32325	704 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SWD3	P38123	315 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RRT2	P38332	387 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MSG5	P38590	489 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	PHB2	P50085	310 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MTM1	P53320	366 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	OCA2	P53949	197 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MMR1	Q06324	491 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SRL2	Q12020	392 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	BUG1	Q12191	341 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	HRT3	Q12347	344 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ERP4	Q12450	207 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	HSL1	P34244	1518 aa		2.56	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	HOM3	P10869	527 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RAD57	P25301	460 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	POP5	P28005	173 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MNS1	P32906	549 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SFH5	P47008	294 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TOM22	P49334	152 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	OAZ1	Q02803	292 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	BCH1	Q05029	724 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	FDH1	Q08911	376 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ATG34	Q12292	412 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MTR10	Q99189	972 aa		2.55	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	DNF2	Q12675	1612 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CYC3	P06182	269 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CPR2	P23285	205 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ERV1	P27882	189 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	KAR9	P32526	644 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YBR056W	P38081	501 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	JLP2	P40206	208 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TCB2	P48231	1178 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	PEX25	Q02969	394 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ADD37	Q03233	198 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	URH1	Q04179	340 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MHR1	Q06630	226 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	VPS54	Q12071	889 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RBD2	Q12270	262 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ISA2	Q12425	185 aa		2.54	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	IMA3	P0CW40	589 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	IMA4	P0CW41	589 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	DAL5	P15365	543 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SPR1	P32603	445 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ZIM17	P42844	174 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	AIM32	Q04689	311 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	IRC25	Q07951	179 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	IMA2	Q08295	589 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RUP1	Q12242	671 aa		2.53	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	COX3	P00420	269 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.52	□□□□□ -2.01	not detected
YLR224W	YLR224W	SWI3	P32591	825 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	VHS2	P40463	436 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YPS6	P40583	537 aa		2.52	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39 ms