RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SMA2Q04658 369 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YFR010W-AP0C5N0 62 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MCM1P11746 286 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W EMP70P32802 667 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W FAR3P46671 204 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W ARC1P46672 376 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MNN5P46982 586 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W GAS2Q06135 555 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YLL007CQ07799 665 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MTR10Q99189 972 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W FLO9P39712 1322 aa8.29□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W HMG1P12683 1054 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W STE12P13574 688 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RPO26P20435 155 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MAK32P23060 363 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W CWH43P25618 953 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W COS111P38308 924 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W HSM3P38348 480 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SCS2P40075 244 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SOK1P40317 901 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W LIA1P47120 325 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RHO4Q00246 291 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W TAD3Q9URQ3 322 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W Q0144Q9ZZW2 109 aa8.28□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RPB5P20434 215 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ILV6P25605 309 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W PTC6P25646 442 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ATS1P31386 333 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W GLG1P36143 616 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W NAS6P50086 228 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W TPC1P53257 314 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W GOR1P53839 350 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W IDP3P53982 420 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W UBX4P54730 416 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W MIX14Q04341 121 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W PLM2Q04383 521 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W YDR124WQ04608 324 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W GMC2Q06201 188 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W PUN1Q06991 263 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W FDH1Q08911 376 aa8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ALG7P07286 448 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ERD1P16151 362 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W AAC3P18238 307 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W SSO1P32867 290 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W MDJ1P35191 511 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W PZF1P39933 429 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CEP3P40969 608 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W MAD3P47074 515 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W RNH70P53331 553 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W INN1P53901 409 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W YPL107WQ02873 248 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W SEI1Q06058 285 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W VPS74Q06385 345 aa8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W YPR096CO13587 100 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W TRP3P00937 484 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W HEM3P28789 327 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CTS1P29029 562 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W TPO5P36029 618 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W AIM2P39721 246 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W LSM4P40070 187 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W PGU1P47180 361 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W GTO1P48239 356 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CDH1P53197 566 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ECM11Q04110 302 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W DCR2Q05924 578 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W SPE4Q12455 300 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W PSF1Q12488 208 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W SFG1Q12507 346 aa8.25□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ARF1P11076 181 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CAT2P32796 670 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W LOT5P34234 306 aa8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W YIL169CP40442 995 aa8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W RPS12P48589 143 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W MKC7P53379 596 aa8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W GIS1Q03833 894 aa8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CRR1Q05790 422 aa8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W ATG34Q12292 412 aa8.24□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W REC107P21651 314 aa8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W MCK1P21965 375 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W GAS1P22146 559 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W CAF4P36130 643 aa8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W FAD1P38913 306 aa8.23□□□□□ -1.09
CPD1YGR247W YEN1P40028 759 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.9 ms