RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	ELP2	P42935	788 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	HXT16	P47185	567 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	MRK1	P50873	501 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	HXT15	P54854	567 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	SPR6	Q01684	191 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YPR022C	Q12139	1133 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	LAG2	Q92325	660 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YCL049C	P25577	312 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	SPC34	P36131	295 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	CIS3	P47001	227 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RAD17	P48581	401 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	GPI8	P49018	411 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	SUN4	P53616	420 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	OAZ1	Q02803	292 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YDL129W	Q07555	291 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RRT8	Q08219	342 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YPR064W	Q12492	139 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	PTP1	P25044	335 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	POL4	P25615	582 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	SFA1	P32771	386 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	SKN1	P33336	771 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	OAR1	P35731	278 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	PAC11	P40960	533 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	10.36	□□□□□ -0.75	not detected
DDR2	YOL052C-A	PMT4	P46971	762 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	BNI4	P53858	892 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	IGO1	P53897	168 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YML096W	Q04489	525 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RRN11	Q04712	507 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	ARR1	Q06596	294 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	TEN1	Q07921	160 aa		10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RNQ1	P25367	405 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RPC82	P32349	654 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	STP2	P38704	541 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	VRG4	P40107	337 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	PAC10	P48363	199 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	ROG1	P53118	685 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RRN5	Q02983	363 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	MFB1	Q04922	465 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YPR097W	Q06839	1073 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	IRC13	Q08630	104 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	RSA1	Q08932	381 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	VIK1	Q12045	647 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YDR262W	Q12331	272 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YDL199C	Q12407	687 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	NTG1	P31378	399 aa		10.34	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	NEO1	P40527	1151 aa		10.34	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	BOP2	Q06150	570 aa		10.34	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	YLR036C	Q07986	203 aa		10.34	□□□□□ -0.75
DDR2	YOL052C-A	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	AGP1	P25376	633 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SRB5	P32585	307 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	BCK2	P33306	851 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	DOA1	P36037	715 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	BNA4	P38169	460 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	ATG14	P38270	344 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	EHT1	P38295	451 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SWD1	P39706	426 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	FET5	P43561	622 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SPO77	Q06134	477 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PUT2	P07275	575 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	FAR1	P21268	830 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	GRR1	P24814	1151 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PRO1	P32264	428 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	OMA1	P36163	345 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YHR177W	P38867	453 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YEL020C	P39994	560 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	FHN1	P53279	174 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MSC1	Q03104	513 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	GLO4	Q12320	285 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MER1	P16523	270 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MGR1	P25573	417 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	NTH1	P32356	751 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	AIM2	P39721	246 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	APC4	Q04601	652 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	ENT2	Q05785	613 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	BNA5	Q05979	453 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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