RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.46	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	GYP1	Q08484	637 aa		5.46	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	YDR262W	Q12331	272 aa		5.46	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	RPN6	Q12377	434 aa		5.46	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CTR86	P25355	563 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SSH4	P32343	579 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CDC5	P32562	705 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SEC17	P32602	292 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	UTH1	P36135	365 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.46	□□□□□ -1.54	RIP-Chip
AMD1	YML035C	ELP2	P42935	788 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PRM10	P42946	383 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.46	□□□□□ -1.54	not detected
AMD1	YML035C	RMR1	P53060	241 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YPL071C	Q02864	156 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PUS9	Q12069	462 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	MLH3	Q12083	715 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	LAG2	Q92325	660 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
AMD1	YML035C	MET30	P39014	640 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ERV46	P39727	415 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	VRG4	P40107	337 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	KEL2	P50090	882 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	BIO3	P50277	480 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	BNI4	P53858	892 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SWF1	Q04629	336 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	COS7	Q07788	383 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YPR022C	Q12139	1133 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	STE6	P12866	1290 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	UNG1	P12887	359 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	DAP2	P18962	818 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PTP1	P25044	335 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CTS1	P29029	562 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SHE4	P51534	789 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	BNA5	Q05979	453 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	REX4	Q08237	289 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YOL131W	Q08270	108 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	IRC13	Q08630	104 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	NSI1	Q12457	570 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SNF8	Q12483	233 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CBS2	P14905	389 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SRB5	P32585	307 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SFA1	P32771	386 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YBR241C	P38142	488 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YHR218W	P38899	603 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YPS6	P40583	537 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ASI1	P54074	624 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	UGO1	Q03327	502 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	MCM21	Q06675	368 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	MFG1	Q07684	458 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RIB7	P33312	244 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SKG1	P36169	355 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YBR285W	P38354	144 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	AVT6	P40074	448 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	LTP1	P40347	161 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RIC1	P40395	1056 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	YJL043W	P47053	257 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	FHN1	P53279	174 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RAD30	Q04049	632 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	STE7	P06784	515 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ITR2	P30606	609 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	HOG1	P32485	435 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SPC34	P36131	295 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	APT2	P36973	181 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	LAS21	P40367	830 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PEX12	Q04370	399 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	OPT2	Q06593	877 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	BMT6	Q12291	365 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RKM5	Q12367	367 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	ALG7	P07286	448 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PEX3	P28795	441 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	PRO1	P32264	428 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AMD1	YML035C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54

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