RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	RIB5	P38145	238 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.63	□□□□□ -1.99	not detected
YLR224W	YLR224W	FAA2	P39518	744 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YGR210C	P42942	411 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	BTN2	P53286	410 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YNR048W	P53740	393 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	FRE4	P53746	719 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SKO1	Q02100	647 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SMA2	Q04658	369 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	REX4	Q08237	289 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	LSB5	P25369	354 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YCR051W	P25631	222 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	HIR2	P32480	875 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	REE1	P40893	198 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	NCA3	P46955	337 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	HMS2	P47175	358 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TOF1	P53840	1238 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	DON1	Q05610	365 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	MDM30	Q05930	598 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	ISN1	Q99312	450 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	BPT1	P14772	1559 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SCEI	P03882	235 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	GEX1	P25596	615 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	KKQ8	P36004	724 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	MMS4	P38257	691 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	MTC6	P38849	526 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PRM5	P40476	318 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	HER2	Q03557	464 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TAF12	Q03761	539 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PPM1	Q04081	328 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	ROY1	Q04847	553 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TMS1	Q12116	473 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	ORT1	Q12375	292 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	AFI1	Q99222	893 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	CDC25	P04821	1589 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SLY1	P22213	666 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	CTR86	P25355	563 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	ITR1	P30605	584 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SHE10	P53075	577 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	GPI15	P53961	229 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	RSN1	Q03516	953 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	BET5	Q03630	159 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SOR2	Q07786	357 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	RMD5	Q12508	421 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PEP1	P32319	1579 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PDX1	P16451	410 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PET123	P17558	318 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SPO7	P18410	259 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	URA4	P20051	364 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	CLN1	P20437	546 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	RPC53	P25441	422 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	ADK2	P26364	225 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	TFB1	P32776	642 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	YAL037W	P39728	267 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	HXT11	P54862	567 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	GIP3	Q03016	1276 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	MED2	Q12124	431 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLR224W	YLR224W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	TRP1	P00912	224 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	DAL2	P25335	343 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	LDB16	P25587	256 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	BRF1	P29056	596 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YEL045C	P32616	141 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	BLI1	P35727	113 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RRN10	P38204	145 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YBR137W	P38276	179 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	PHO86	P46956	311 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	SDT1	P53078	280 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	RMT2	Q03305	412 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ACL4	Q03771	387 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.58	□□□□□ -2
YLR224W	YLR224W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.1 ms