RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	CTR86	P25355	563 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	HEL1	P36113	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YAL037W	P39728	267 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RPH1	P39956	796 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	EFM4	P40516	257 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RPR2	P40571	144 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	REX4	Q08237	289 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	AYT1	Q12226	474 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RUP1	Q12242	671 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	SET6	Q12529	373 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	SPT7	P35177	1332 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	COX3	P00420	269 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	MDM31	P38880	579 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RRT5	P43607	289 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	SSN8	P47821	323 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	AVT4	P50944	713 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	COS10	P52924	374 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	BTN2	P53286	410 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	MRP51	Q02950	344 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PMR1	P13586	950 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ATS1	P31386	333 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PCA1	P38360	1216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
YLL017W	YLL017W	SNM1	P40993	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	POP6	P53218	158 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	CRZ1	P53968	678 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PEP1	P32319	1579 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	FAD1	P38913	306 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	HMS2	P47175	358 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YNR048W	P53740	393 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	CAF40	P53829	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	GPI15	P53961	229 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PIR3	Q03180	325 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	URH1	Q04179	340 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	MUM3	Q08750	479 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ORT1	Q12375	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	SKS1	Q12505	502 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	BPT1	P14772	1559 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	LSB5	P25369	354 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	GAT2	P40209	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YPS6	P40583	537 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YJL213W	P40896	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YDL186W	P48568	277 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	TLG1	Q03322	224 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	VTI1	Q04338	217 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	NDL1	Q06568	189 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	TIM18	Q08749	192 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	NDD1	Q08887	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RMD5	Q12508	421 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	HEM2	P05373	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	STN1	P38960	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	MST28	P39552	234 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	YAT2	P40017	923 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	FRE4	P53746	719 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	RSN1	Q03516	953 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	GRX3	Q03835	250 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	ATG34	Q12292	412 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YLL017W	YLL017W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RAD57	P25301	460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MLC1	P53141	149 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	EOS1	P53938	366 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PGC1	Q08959	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PPT2	Q12036	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	DNF1	P32660	1571 aa		4.65	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.9 ms