RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A PDS5Q04264 1277 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SYO1Q07395 620 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A THI20Q08224 551 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SPP41P38904 1435 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RIM15P43565 1770 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SKG6P32900 734 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MSR1P38714 643 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YHR054CP38780 354 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PFS2P42841 465 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A BUD13P46947 266 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SLD5Q03406 294 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MIX17Q03667 156 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ARO1P08566 1588 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ATG2P53855 1592 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PIS1P06197 220 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TIF5P38431 405 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MDE1P47095 244 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CTF18P49956 741 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CLD1P53264 445 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MUB1Q03162 620 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YDR387CQ04162 555 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YPR022CQ12139 1133 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YOR338WQ99326 363 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ADH2P00331 348 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SAG1P20840 650 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A IFA38P38286 347 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NTC20P38302 140 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A VHC1P38329 1120 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A HXT9P40885 567 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CPR6P53691 371 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A OAZ1Q02803 292 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PCD1Q12524 340 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YBL111CQ3E7Y5 667 aa0.23□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NUP2P32499 720 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SOR1P35497 357 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YKR032WP36127 104 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A FRT2P39734 528 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A AZR1P50080 613 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A GTR1Q00582 310 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MRP51Q02950 344 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A UTP15Q04305 513 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RPO31P04051 1460 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SUC2P00724 532 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A HIP1P06775 603 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RAD14P28519 371 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PMT1P33775 817 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PUG1P40100 303 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MMF1P40185 145 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A VPS4P52917 437 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A COS10P52924 374 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RCN2Q12044 265 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NKP1Q12493 238 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SMC4Q12267 1418 aa0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A DPH2P32461 534 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YIP1P53039 248 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RHO5P53879 331 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A COG6P53959 839 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ADE13Q05911 482 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A FAR10Q06001 478 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RIX7Q07844 837 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YLR278CQ05854 1341 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ILV5P06168 395 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PGS1P25578 521 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RRP1P35178 278 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A AUR1P36107 401 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PFF1P38244 976 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A STP2P38704 541 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A UTP18P40362 594 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SWP82P43554 623 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ERO1Q03103 563 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A FSH2Q05015 223 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A Q0010Q9ZZX9 128 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SPO14P36126 1683 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A COX4P04037 155 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RHO2P06781 192 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PPH22P23595 377 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YCR007CP25354 239 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A UTR5P32630 166 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A BMT2P38278 337 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A WSS1P38838 269 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YPS6P40583 537 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A GUF1P46943 645 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YMR087WQ04299 284 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RBS1Q05672 457 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SMC5Q08204 1093 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RIM20Q12033 661 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SRO7Q12038 1033 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A JID1Q12350 301 aa0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ARD1P07347 238 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SPS4P09937 338 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PCF11P39081 626 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A GAB1P41733 394 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YGR149WP48236 432 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A DSK2P48510 373 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RHO4Q00246 291 aa0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.9 ms