RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SOR2	Q07786	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
RPS0B	YLR048W	STV1	P37296	890 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	APD1	P38281	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SPT8	P38915	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	UBP8	P50102	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SUN4	P53616	420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ARP10	Q04549	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SMA2	Q04658	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RDR1	Q08904	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RPN13	O13563	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SUC2	P00724	532 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	QDR3	P38227	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PHO90	P39535	881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	HXT9	P40885	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PHO86	P46956	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	MRK1	P50873	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SOL4	P53315	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	ECM18	Q04623	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	BSP1	Q06604	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PUS9	Q12069	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SNC1	P31109	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RAD24	P32641	659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YSC83	P32792	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YUH1	P35127	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YBR139W	P38109	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YEL020C	P39994	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YPS6	P40583	537 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PAC11	P40960	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	AVT1	P47082	602 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PKP2	P53170	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	DSL1	P53847	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RHO4	Q00246	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	CDC21	P06785	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	BAR1	P12630	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	GAL3	P13045	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PSO2	P30620	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	INM1	P38710	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	BRO1	P48582	844 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	GND2	P53319	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	TPO3	Q06451	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	MCP2	Q06567	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SSK1	Q07084	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	CHS7	P38843	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	END3	P39013	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	AIM20	P40451	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	GCD10	P41814	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	AGX1	P43567	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	TRS85	P46944	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YHC3	P47040	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	NUP84	P52891	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YGR266W	P53326	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RTT102	P53330	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	TLG1	Q03322	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	TAF12	Q03761	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	STE23	Q06010	1027 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PEX27	Q08580	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	EDE1	P34216	1381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	CHS1	P08004	1131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	UTR4	P32626	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RTT107	P38850	1070 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PAC2	P39937	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RRT8	Q08219	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PFA4	Q12006	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	MAS1	P10507	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RAD57	P25301	460 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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