RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	ATG33	Q06485	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	OMS1	Q06668	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ENB1	Q08299	606 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SPE4	Q12455	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PHO5	P00635	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	CDC21	P06785	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	AAD3	P25612	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RPP1	P38786	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	TAF6	P53040	516 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MDM34	P53083	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YGR015C	P53208	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SHY1	P53266	389 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RMI1	Q02685	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	STE3	P06783	470 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NMT1	P14743	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PTH2	P34222	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NUP120	P35729	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	EMP65	P40085	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PRM2	P40534	656 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	BNA2	P47125	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YJR149W	P47177	404 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YNL260C	P53846	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SLM2	P53955	656 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	UBX4	P54730	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ECM9	Q02202	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	VHS1	Q03785	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	APC9	Q12107	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NTO1	Q12311	748 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SUL2	Q12325	893 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PST1	Q12355	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	GPR1	Q12361	961 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	IRA2	P19158	3079 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YLR415C	O13578	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RHO2	P06781	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SPT3	P06844	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SEC15	P22224	910 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NGG1	P32494	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MRE11	P32829	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SDH3	P33421	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RRN3	P36070	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ARA1	P38115	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YBR032W	P38223	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YHR033W	P38690	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	INM1	P38710	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MGS1	P40151	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NDE1	P40215	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	FKH2	P41813	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	TRS85	P46944	698 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YJR030C	P47101	745 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	TIS11	P47977	285 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	COS12	P53053	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RTS3	P53289	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	GTR2	P53290	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	IBD2	P53892	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MRS2	Q01926	470 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PFA4	Q12006	378 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ATG29	Q12092	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RGT2	Q12300	763 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	RKM5	Q12367	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SRN2	Q99176	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ARG1	P22768	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	CWP1	P28319	239 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MEI5	P32489	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	COX13	P32799	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SFC1	P33303	322 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms