RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C YHB1P39676 399 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C TAX4P47030 604 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C ERG26P53199 349 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C VPS62P53285 467 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YNL260CP53846 198 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C DSL1P53847 754 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YML053CQ04978 212 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C GEP3Q08622 556 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C PUS9Q12069 462 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C TRM13Q12383 476 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C Q0010Q9ZZX9 128 aa6.3□□□□□ -1.4
SHO1YER118C ADE4P04046 510 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C PET111P08468 800 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C NFT1P0CE68 1218 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C KRS1P15180 591 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C KAR4P25583 335 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C PRO3P32263 286 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data6.29□□□□□ -1.4not detected
SHO1YER118C CYM1P32898 989 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C ADE17P38009 592 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YPT10P38146 199 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C LAS21P40367 830 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C SPG5P42933 373 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C UBC11P52492 156 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YIP4P53093 235 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C PDR8Q06149 701 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C MRPL35Q06678 367 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C NSE1Q07913 336 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C PEX27Q08580 376 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C RDR1Q08904 546 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C RAV1P47104 1357 aa6.29□□□□□ -1.4
SHO1YER118C SCEIP03882 235 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C MSF1P08425 469 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C DAL2P25335 343 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C MET22P32179 357 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YSC83P32792 385 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C EMP70P32802 667 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C ECT1P33412 323 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C RPC25P35718 212 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C QDR3P38227 689 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YBR053CP38235 358 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YHR122WP38829 231 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C MUP1P50276 574 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C CTS2Q06350 511 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YDL086WQ07505 273 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C BSC6Q08280 497 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C TGS1Q12052 315 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C ZPS1Q12512 249 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C SPO24Q3E752 67 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C YOS9Q99220 542 aa6.28□□□□□ -1.4
SHO1YER118C SEC63P14906 663 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C GMH1P36125 273 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C IML3P38265 245 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C SAF1P38352 637 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C VBA2P38358 474 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C DBP8P38719 431 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C YHR182WP38870 785 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C PRP39P39682 629 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C DIP5P53388 608 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C MUK1Q02866 612 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C TAF12Q03761 539 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C URH1Q04179 340 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C BTS1Q12051 335 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C MLH3Q12083 715 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C RUP1Q12242 671 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C YDR262WQ12331 272 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C RMD5Q12508 421 aa6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SHO1YER118C SIR3P06701 978 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C PEP4P07267 405 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C ABF1P14164 731 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C OSM1P21375 501 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C PTC6P25646 442 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C GSY2P27472 705 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C ZIP1P31111 875 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C GDA1P32621 518 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C RPC34P32910 317 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C RRN10P38204 145 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C YHR177WP38867 453 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C GAT2P40209 560 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C PAC11P40960 533 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C DRN1P53255 507 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C ESBP6P53918 673 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C SHR3Q02774 210 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa6.26□□□□□ -1.41
SHO1YER118C ATP10P18496 279 aa6.25□□□□□ -1.41
SHO1YER118C YPK2P18961 677 aa6.25□□□□□ -1.41
SHO1YER118C CNA1P23287 553 aa6.25□□□□□ -1.41
SHO1YER118C HXT1P32465 570 aa6.25□□□□□ -1.41
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