RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.28	□□□□□ -2.36	not detected
YBL053W	YBL053W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBL053W	YBL053W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBL053W	YBL053W	ZRG17	P53735	605 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBL053W	YBL053W	REG1	Q00816	1014 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBL053W	YBL053W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBL053W	YBL053W	YOR338W	Q99326	363 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBL053W	YBL053W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	PUT4	P15380	627 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ZRC1	P20107	442 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YCL049C	P25577	312 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	PPQ1	P32945	549 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YBR137W	P38276	179 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	STP2	P38704	541 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	AAD10	P47182	288 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	COQ5	P49017	307 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	RIF2	Q06208	395 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YLR302C	O13544	120 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	SLY1	P22213	666 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	GYP6	P32806	458 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	HOT1	Q03213	719 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	VTI1	Q04338	217 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	NBP2	Q12163	236 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	POL4	P25615	582 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YEF1	P32622	495 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	TRR2	P38816	342 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	CCT6	P39079	546 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MNN5	P46982	586 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YIP1	P53039	248 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	VHT1	P53241	593 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YNR048W	P53740	393 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MRPL13	Q02204	264 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	TCO89	Q08921	799 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	NUC1	P08466	329 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MTF2	P10849	440 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	DAL5	P15365	543 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MKK1	P32490	508 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	POP1	P41812	875 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	COS4	P43542	379 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	IGD1	P43598	195 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	RGM1	Q00453	211 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	SGT1	Q08446	395 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	VPS54	Q12071	889 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	AHC1	Q12433	566 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	PCD1	Q12524	340 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MSS18	P08593	268 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ALY1	P36117	915 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YCR041W	P37265	110 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	SDH4	P37298	181 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	PFS1	P38872	237 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ERP2	P39704	215 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	SYG1	P40528	902 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	LCL3	P53153	274 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	CLD1	P53264	445 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	TGL2	P54857	326 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	HIM1	Q06674	414 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ATP11	P32453	318 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	XRS2	P33301	854 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	GRX7	P38068	203 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YIL029C	P40538	142 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ATG18	P43601	500 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	ECM27	P47144	725 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	MST27	P53176	234 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YBL053W	YBL053W	COX13	P32799	129 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	CNS1	P33313	385 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	PEX22	P39718	180 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	BNS1	P50084	137 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YLR345W	Q06137	509 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	LDS2	Q08218	356 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	STE7	P06784	515 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	PEP3	P27801	918 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ITR1	P30605	584 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	SKT5	P34226	696 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MBB1	P39534	108 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	JLP2	P40206	208 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	HIS6	P40545	261 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	NUP116	Q02630	1113 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	CDD1	Q06549	142 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YPL272C	Q08984	517 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YPR022C	Q12139	1133 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	CEX1	Q12453	761 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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