RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G SLD3P53135 668 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GUP1P53154 560 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RIM8P53179 542 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ERG26P53199 349 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YGR067CP53243 804 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G DAM1P53267 343 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RSM27P53305 110 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YPR003CP53394 754 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G FRE4P53746 719 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G NAF1P53919 492 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G APJ1P53940 528 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G REG1Q00816 1014 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ENA2Q01896 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RSC4Q02206 625 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SDC1Q03323 175 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RSN1Q03516 953 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GIS1Q03833 894 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G DON1Q05610 365 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G NDL1Q06568 189 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GRS2Q06817 618 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SNA4Q07549 140 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G XYL2Q07993 356 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data0.64□□□□□ -2.31not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G YVC1Q12324 675 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G KCS1Q12494 1050 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ENA5Q12691 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YOS9Q99220 542 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G LEU4P06208 619 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G FUM1P08417 488 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SUI3P09064 285 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YEL076C-AP0CX16 216 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR464WP0CX17 216 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR214C-DP0CX93 97 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G KIN2P13186 1147 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CUP2P15315 225 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PET123P17558 318 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ISY1P21374 235 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G APA2P22108 325 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G VAN1P23642 535 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ROX3P25046 220 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SED4P25365 1065 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SPT5P27692 1063 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SSE1P32589 693 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YSC84P32793 468 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G TFA2P36145 328 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR071WP38243 211 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G HSL7P38274 827 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR045WP38775 560 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YEL076CP39971 216 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G IRR1P40541 1150 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G REE1P40893 198 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G POP1P41812 875 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ARH1P48360 493 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MSE1P48525 536 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G AVT4P50944 713 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SHE4P51534 789 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ACS2P52910 683 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PEX31P53203 462 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SDA1P53313 767 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RLI1Q03195 608 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GSF2Q04697 403 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G VAC14Q06708 880 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SPO75Q07798 868 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ESA1Q08649 445 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MUM3Q08750 479 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PGC1Q08959 321 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MMT2Q08970 484 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YPL277CQ08989 487 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SLF1Q12034 447 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PUS9Q12069 462 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G LDB17Q12342 491 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G DBP10Q12389 995 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CEX1Q12453 761 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SPE4Q12455 300 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G AFI1Q99222 893 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YOR019WQ99248 730 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ECM3Q99252 613 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SEY1Q99287 776 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G COX6P00427 148 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G TUF1P02992 437 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G STE6P12866 1290 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G HSC82P15108 705 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ERD1P16151 362 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G EST1P17214 699 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CKA2P19454 339 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G UTR1P21373 530 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SLY1P22213 666 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G FPS1P23900 669 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G NFS1P25374 497 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G DCC1P25559 380 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YCL002CP25565 263 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G STP22P25604 385 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms