RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B SLD3P53135 668 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GUP1P53154 560 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RIM8P53179 542 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ERG26P53199 349 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR067CP53243 804 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B DAM1P53267 343 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RSM27P53305 110 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR003CP53394 754 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B FRE4P53746 719 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B NAF1P53919 492 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B APJ1P53940 528 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B REG1Q00816 1014 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ENA2Q01896 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RSC4Q02206 625 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SDC1Q03323 175 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RSN1Q03516 953 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GIS1Q03833 894 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B DON1Q05610 365 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B NDL1Q06568 189 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GRS2Q06817 618 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SNA4Q07549 140 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B XYL2Q07993 356 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data0.64□□□□□ -2.31not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B YVC1Q12324 675 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B KCS1Q12494 1050 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ENA5Q12691 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YOS9Q99220 542 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B LEU4P06208 619 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B FUM1P08417 488 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SUI3P09064 285 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YEL076C-AP0CX16 216 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR464WP0CX17 216 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR214C-DP0CX93 97 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B KIN2P13186 1147 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CUP2P15315 225 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PET123P17558 318 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ISY1P21374 235 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B APA2P22108 325 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B VAN1P23642 535 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ROX3P25046 220 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SED4P25365 1065 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SPT5P27692 1063 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SSE1P32589 693 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YSC84P32793 468 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B TFA2P36145 328 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR071WP38243 211 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B HSL7P38274 827 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR045WP38775 560 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YEL076CP39971 216 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B IRR1P40541 1150 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B REE1P40893 198 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B POP1P41812 875 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ARH1P48360 493 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MSE1P48525 536 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B AVT4P50944 713 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SHE4P51534 789 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ACS2P52910 683 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX31P53203 462 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SDA1P53313 767 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RLI1Q03195 608 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GSF2Q04697 403 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B VAC14Q06708 880 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SPO75Q07798 868 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ESA1Q08649 445 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MUM3Q08750 479 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PGC1Q08959 321 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MMT2Q08970 484 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL277CQ08989 487 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SLF1Q12034 447 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PUS9Q12069 462 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B LDB17Q12342 491 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B DBP10Q12389 995 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CEX1Q12453 761 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SPE4Q12455 300 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B AFI1Q99222 893 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR019WQ99248 730 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ECM3Q99252 613 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SEY1Q99287 776 aa0.63□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B COX6P00427 148 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B TUF1P02992 437 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B STE6P12866 1290 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B HSC82P15108 705 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ERD1P16151 362 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B EST1P17214 699 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CKA2P19454 339 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B UTR1P21373 530 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SLY1P22213 666 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B FPS1P23900 669 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B NFS1P25374 497 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B DCC1P25559 380 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YCL002CP25565 263 aa0.62□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B STP22P25604 385 aa0.62□□□□□ -2.31
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