RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	MCH4	Q08268	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SFG1	Q12507	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	COX3	P00420	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	GAL7	P08431	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SEC63	P14906	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PUT4	P15380	627 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CDC43	P18898	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	REC114	P32841	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MSN2	P33748	704 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ROT2	P38138	954 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	DUG2	P38149	878 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	EFM2	P38347	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MSG5	P38590	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RFC3	P38629	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CIN1	P40987	1014 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RPN14	P53196	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	TIM44	Q01852	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SMA1	Q02651	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SHR3	Q02774	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ULA1	Q12059	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
RPS0B	YLR048W	RRD2	Q12461	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SCEI	P03882	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PEP5	P12868	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	GSY2	P27472	705 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	POP1	P41812	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	STB4	P50104	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MPS2	P53159	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PIG1	Q06216	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	IPK1	Q06667	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	GSH2	Q08220	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RAD61	Q99359	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	TYR1	P20049	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YMC1	P32331	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RRN10	P38204	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MNL1	P38888	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SSO2	P39926	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SDS3	P40505	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YIL060W	P40519	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SHE10	P53075	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ROG1	P53118	685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	BUD32	P53323	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	EKI1	Q03764	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	TMN2	Q04562	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	VPS63	O13549	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ERG11	P10614	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SAG1	P20840	650 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ATP11	P32453	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ECM25	P32525	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	IME2	P32581	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ELM1	P32801	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	LAG1	P38703	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ARN1	P38731	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	STN1	P38960	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SYG1	P40528	902 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YFR018C	P43599	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RRN5	Q02983	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SWF1	Q04629	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	NSE1	Q07913	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	BUG1	Q12191	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RUP1	Q12242	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YPR089W	O13585	888 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RPB8	P20436	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PET18	P25362	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MIC60	P36112	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CBP4	P37267	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YBL028C	P38202	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SPC97	P38863	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	GPI16	P38875	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	GAT2	P40209	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SAS2	P40963	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	TAX4	P47030	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YJR154W	P47181	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	HSP31	Q04432	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	RNH1	Q04740	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	CUR1	Q06469	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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