RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PDE1P22434 369 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VMA8P32610 256 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W IRC6P43615 237 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W IPI3P53877 555 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ATG21Q02887 496 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YDR239CQ03780 787 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PLM2Q04383 521 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YBR255C-AQ3E776 120 aa3.82□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ATR1P13090 542 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YKL050CP35736 922 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MRPL40P36534 297 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TRM5P38793 499 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VPS45P38932 577 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W CCT6P39079 546 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MDV1P47025 714 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TAF6P53040 516 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RMR1P53060 241 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RET3P53600 189 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SRL4Q03085 281 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YDR476CQ03362 224 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RAD30Q04049 632 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MLH2Q07980 695 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ICL2Q12031 575 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RED1P14291 827 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PHO81P17442 1178 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W BEM3P32873 1128 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YBR138CP38277 524 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PAC11P40960 533 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W BST1P43571 1029 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W APS3P47064 194 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YGL108CP53139 140 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ARK1P53974 638 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DYN3Q04949 312 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DXO1Q06349 442 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MDM36Q06820 579 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YDL114WQ07530 308 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W BAG7Q12128 409 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ARP6Q12509 438 aa3.81□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PHO84P25297 587 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SIP1P32578 815 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SSO1P32867 290 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PDX3P38075 228 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W XBP1P40489 647 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SER33P40510 469 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SRB7P47822 140 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ZRG17P53735 605 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ECM11Q04110 302 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YML053CQ04978 212 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W NNT1Q05874 261 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YPL191CQ08930 360 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YDL109CQ12103 647 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.8□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W COR1P07256 457 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MSM1P22438 575 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PTP1P25044 335 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W CLG1P35190 452 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YKL063CP35725 167 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VPS51P36116 164 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DSE1P40077 573 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ESL1P40456 1118 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MAM33P40513 266 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W FMP32P43557 207 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W NUP84P52891 726 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SED5Q01590 340 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SHR3Q02774 210 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W URC2Q04411 772 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YPR078CQ06813 372 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YLR031WQ07978 186 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SGT1Q08446 395 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MF(ALPHA)1P01149 165 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TFB1P32776 642 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SNO3P43544 222 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SAD1P43589 448 aa3.79□□□□□ -1.8
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