RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	NAT2	P37293	288 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YFL067W	P43537	175 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	TWF1	P53250	332 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	CAF40	P53829	373 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	ATG29	Q12092	213 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	TMS1	Q12116	473 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	MED1	Q12321	566 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	CPR4	P25334	318 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	AFG1	P32317	509 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YBL059W	P34224	193 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	MRPL4	P36517	319 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YCR041W	P37265	110 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	SWD3	P38123	315 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	MET18	P40469	1032 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YGR149W	P48236	432 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	ADD37	Q03233	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	PBA1	Q05778	276 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	ERV2	Q12284	196 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	MET17	P06106	444 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	CMC1	P36064	111 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	VID24	P38263	362 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	HXT14	P42833	540 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	SHE10	P53075	577 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	PCP1	P53259	346 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YPL199C	Q08954	240 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	RIM20	Q12033	661 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	RRI2	Q12348	645 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	CLN3	P13365	580 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	PPH22	P23595	377 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YEL045C	P32616	141 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	SEC66	P33754	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	CBP4	P37267	147 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	URB2	P47108	1174 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YGL242C	P53066	181 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	TOF1	P53840	1238 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	JJJ1	P53863	590 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	ODC1	Q03028	310 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	ESA1	Q08649	445 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.72	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	RAD14	P28519	371 aa		2.72	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	PNG1	Q02890	363 aa		2.72	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	SOV1	Q04748	898 aa		2.72	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
LRP1	YHR081W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	ITR1	P30605	584 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	NIP100	P33420	868 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.98	not detected
LRP1	YHR081W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	NDE1	P40215	560 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	NCA3	P46955	337 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	YIP1	P53039	248 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	YDR387C	Q04162	555 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	GRX6	Q12438	231 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	RHO2	P06781	192 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	MIX23	P38162	196 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	SMF1	P38925	575 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.7	□□□□□ -1.98	not detected
LRP1	YHR081W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	YGR210C	P42942	411 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	MRP51	Q02950	344 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	SIL1	Q08199	421 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	HRT3	Q12347	344 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	ROX1	P25042	368 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	ECM25	P32525	599 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	PIM1	P36775	1133 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	RIB5	P38145	238 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	YBR137W	P38276	179 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	MST28	P39552	234 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	ESL1	P40456	1118 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	PRM5	P40476	318 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	LAM5	P43560	674 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	IRC6	P43615	237 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	TIS11	P47977	285 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LRP1	YHR081W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98

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