RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	IRC15	Q02733	499 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	TAF12	Q03761	539 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	BSC2	Q05611	235 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	HRD3	Q05787	833 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YPS7	Q06325	596 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RPN6	Q12377	434 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PNS1	Q12412	539 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	IDI1	P15496	288 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	CLN1	P20437	546 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	HIR2	P32480	875 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	CTF13	P35203	478 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YKL063C	P35725	167 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RIM4	P38741	713 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	HXT7	P39004	570 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ERV46	P39727	415 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MXR1	P40029	184 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RGI2	P40188	164 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	BST1	P43571	1029 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	IRC6	P43615	237 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	NUP85	P46673	744 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YJR098C	P47139	656 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SCS3	P53012	380 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SNF12	P53628	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	GOT1	Q03554	138 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RIF2	Q06208	395 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	BAG7	Q12128	409 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PUT2	P07275	575 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	CDC4	P07834	779 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	CAP2	P13517	287 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YCR099C	P25657	155 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RAD27	P26793	382 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SPT14	P32363	452 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RPC34	P32910	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MKS1	P34072	584 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	GPT2	P36148	743 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	GPX2	P38143	162 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ARP1	P38696	384 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ACO2	P39533	789 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	NTA1	P40354	457 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	OPT1	P40897	799 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MRPS18	P42847	217 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PTR3	P43606	678 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	CPR8	P53728	308 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MUK1	Q02866	612 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PFA5	Q03289	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	VTA1	Q06263	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MCD1	Q12158	566 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ICT1	Q12385	394 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RHB1	P25378	209 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	BAP2	P38084	609 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	HXT5	P38695	592 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	EFM1	P38732	585 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PNT1	P38969	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SER2	P42941	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ALR2	P43553	858 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	FET5	P43561	622 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	BIT61	P47041	543 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	MRPL50	P53724	139 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	CAF120	P53836	1060 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
SSZ1	YHR064C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SVS1	Q12254	260 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RBD2	Q12270	262 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	GLE1	Q12315	538 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	ARG81	P05085	880 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	HMG1	P12683	1054 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	SEN2	P16658	377 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	DAP2	P18962	818 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	PHO3	P24031	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SSZ1	YHR064C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58

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